RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ABCG4Q9H172 646 aa8.85□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 C1orf105O95561 183 aa8.84□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PDE4D-201ENST00000309641 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
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PDE4D-201ENST00000309641 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.83□□□□□ -1
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PDE4D-201ENST00000309641 TTLL9Q3SXZ7 439 aa8.83□□□□□ -1
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PDE4D-201ENST00000309641 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 RASGRP3Q8IV61 690 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 LINC01555Q8NAE3 123 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 OR10G6Q8NH81 332 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 OR2W6PQ8NHA6 318 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 ASB11Q8WXH4 323 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 SH3KBP1Q96B97 665 aa8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
PDE4D-201ENST00000309641 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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