RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2K7O14733 419 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC19A2O60779 497 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 WFS1O76024 890 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 NDST3O95803 873 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 RARAP10276 462 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 GZMAP12544 262 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CXCR2P25025 360 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 RAB28P51157 221 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TDGF1P3P51864 188 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPAL4Q0D2K0 466 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PCSK7Q16549 785 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CAMK4Q16566 473 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CES4AQ5XG92 561 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 AMIGO1Q86WK6 493 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP21Q8N119 569 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD6Q8NC69 237 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 HAS2Q92819 552 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF670Q9BS34 389 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MVB12BQ9H7P6 319 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 DTLQ9NZJ0 730 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 IP6K2Q9UHH9 426 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO6Q9UM54 1294 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CDYLQ9Y232 598 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 NEU2Q9Y3R4 380 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC168Q8NDH2 2452 aa7.59□□□□□ -1.19
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFHX3Q15911 3703 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1B0GX78 115 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MFSD11O43934 449 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HPP00738 406 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FTLP02792 175 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 POLBP06746 335 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 UMODP07911 640 aa7.58□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 ICAM2P13598 275 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ACPPP15309 386 aa7.58□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 CD151P48509 253 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFSF10P50591 281 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FANCCQ00597 558 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FOLH1Q04609 750 aa7.58□□□□□ -1.2
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PGGT1B-201ENST00000296642 AP1B1Q10567 949 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DSG2Q14126 1118 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC9A5Q14940 896 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PDK2Q15119 407 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM214AQ32MH5 1076 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SPESP1Q6UW49 350 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 OVCH1Q7RTY7 1134 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 HM13Q8TCT9 377 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A51Q9H1U9 297 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DEF6Q9H4E7 631 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 BPIFA1Q9NP55 256 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 STMN3Q9NZ72 180 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 CHMP5Q9NZZ3 219 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM8A1Q9UBU6 413 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PLCL2Q9UPR0 1127 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.58□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PCM1Q15154 2024 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0J9YY10 115 aa7.57□□□□□ -1.2
PGGT1B-201ENST00000296642 MYO1FO00160 1098 aa7.57□□□□□ -1.2
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