RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296098.4

TRIM54-201, Transcript of tripartite motif containing 54, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM54, Length 2,027 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54-201ENST00000296098 MYLIPQ8WY64 445 aa23.45■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 HEPHQ9BQS7 1158 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 SLC12A9Q9BXP2 914 aa23.45■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ACTR8Q9H981 624 aa23.45■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa23.43■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H2ADP20671 130 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 NAT16Q8N8M0 369 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 HIST1H2AJQ99878 128 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 SATL1Q86VE3 508 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 MRGPRX3Q96LB0 322 aa23.42■■□□□ 1.34
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TRIM54-201ENST00000296098 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 MARK1Q9P0L2 795 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa23.42■■□□□ 1.34
TRIM54-201ENST00000296098 ARHGAP10A1A4S6 786 aa23.41■■□□□ 1.34
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