RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 THADAQ6YHU6 1953 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 SH3PXD2BA1X283 911 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP10O43572 662 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NFKB2Q00653 900 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CSHL1Q14406 222 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 CST6Q15828 149 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 AADATQ8N5Z0 425 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN10Q96LJ8 280 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 NSMCE3Q96MG7 304 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ITM2CQ9NQX7 267 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX3Q9UBR4 397 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 INSIG1O15503 277 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 RALGDSQ12967 914 aa25.83■■□□□ 1.73
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM47BQ8NA70 645 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 FSD1LQ9BXM9 530 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 ARNT2Q9HBZ2 717 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa25.82■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLC7A2P52569 658 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 IL10RBQ08334 325 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 ARSIQ5FYB1 569 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN8Q6JVE9 175 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RANBP10Q6VN20 620 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR23BQ6ZRT6 265 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF554Q86TJ5 538 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA22Q8NHS9 363 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SGF29Q96ES7 293 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP44Q9C0F1 390 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GSTO2Q9H4Y5 243 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GID8Q9NWU2 228 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PP55 124 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GPR180Q86V85 440 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CLYBLQ8N0X4 340 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TSPEARQ8WU66 669 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8D1Q8WZ84 308 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CFAP54Q96N23 3096 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 LEFTY1O75610 366 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GPIP06744 558 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ACADMP11310 421 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GPX3P22352 226 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FASP25445 335 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DRD3P35462 400 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 RHOAP61586 193 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2R1Q6VVX0 501 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2AP1Q8NGE2 309 aa25.81■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR3BQ9P1U1 418 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK9Q9BZ29 2069 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS12A0PJE2 317 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC78A2IDD5 438 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TIPRLO75663 272 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DNTTP04053 509 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF4P08620 206 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSL1P33121 698 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 GRIA3P42263 894 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TBCELQ5QJ74 424 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL35Q6PF15 583 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 PGBD5Q8N414 524 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA6LQ8N4H0 392 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SUMF1Q8NBK3 374 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CANT1Q8WVQ1 401 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ISOC1Q96CN7 298 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf60Q96EN9 201 aa25.8■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF839A8K0R7 811 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 SOCS2O14508 198 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 MERTKQ12866 999 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED1Q13445 227 aa25.8■■□□□ 1.72
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP68Q76N32 757 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEFF1Q8IYR6 380 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 ADI1Q9BV57 179 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FAIMQ9NVQ4 179 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 FIS1Q9Y3D6 152 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP192Q8TEP8 1941 aa25.8■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa25.79■■□□□ 1.72
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1B0GTW7 788 aa25.79■■□□□ 1.72
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