RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637100.1

CLN3-255, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN3, Length 1,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-255ENST00000637100 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 BBS12Q6ZW61 710 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 DET1Q7L5Y6 550 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 DAAM2Q86T65 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 NXPE1Q8N323 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ULK4Q96C45 1275 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 DEF6Q9H4E7 631 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 BTN3A1O00481 513 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZNF185O15231 689 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 POLBP06746 335 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ATP1A4Q13733 1029 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SSPNQ14714 243 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GPR33Q49SQ1 333 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 NAT14Q8WUY8 206 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 LCN9Q8WX39 176 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 TCTN2Q96GX1 697 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CCDC42Q96M95 316 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 COG4Q9H9E3 785 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 POLEQ07864 2286 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 H7C0S8 307 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZNF749O43361 778 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 APOC2P02655 101 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 TPM3P06753 285 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GSTM1P09488 218 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RALBP11234 206 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CYP2A7P20853 494 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PSMA3P25788 255 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GSTM4Q03013 218 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GSE1Q14687 1217 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ODF2Q5BJF6 829 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 KAZNQ674X7 775 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SNX20Q7Z614 316 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 MRGPREQ86SM8 312 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RAB43Q86YS6 212 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 COPS8Q99627 209 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 NRTNQ99748 197 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FICDQ9BVA6 458 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 LRBAP50851 2863 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 C2orf74A8MZ97 194 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 E7EQ34 232 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 LDB2O43679 373 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SPOPO43791 374 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CRTAMO95727 393 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CLDN1O95832 211 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 IGHEP01854 428 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 CD63P08962 238 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 RBL1P28749 1068 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 PDHA2P29803 388 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GCGRP47871 477 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 LMAN1P49257 510 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 MYBPC3Q14896 1274 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 DCAF10Q5QP82 559 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SARM1Q6SZW1 724 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 VSTM4Q8IW00 320 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 NACC2Q96BF6 587 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 C19orf60Q96EN9 201 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 SGSM3Q96HU1 749 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-255ENST00000637100 GBP5Q96PP8 586 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms