RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628078.2

TCF4-262, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 1,277 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-262	ENST00000628078	LDB2	O43679	373 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ANXA9	O76027	345 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	CAPN1	P07384	714 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	CTSB	P07858	339 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	COL8A1	P27658	744 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ADRA1A	P35348	466 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	BCL7A	Q4VC05	210 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	TAS2R42	Q7RTR8	314 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	TAB3	Q8N5C8	712 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078		Q8NA96	180 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ACTL9	Q8TC94	416 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SEC14L1	Q92503	715 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	COPS8	Q99627	209 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	HGH1	Q9BTY7	390 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	FANCE	Q9HB96	536 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	HCRTR1	O43613	425 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	RALB	P11234	206 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	NDUFS1	P28331	727 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	MC4R	P32245	332 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	RORA	P35398	523 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	VAV2	P52735	878 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	GSDMD	P57764	484 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	PRPSAP1	Q14558	356 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	TCEAL1	Q15170	157 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ITPRIPL1	Q6GPH6	555 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	BBS12	Q6ZW61	710 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	NXPE1	Q8N323	547 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	HM13	Q8TCT9	377 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ZFPM2	Q8WW38	1151 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	CCM2	Q9BSQ5	444 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	COG4	Q9H9E3	785 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	FAM60A	Q9NP50	221 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	INTU	Q9ULD6	942 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF4-262	ENST00000628078	APOC4-APOC2	K7ER74	178 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	CRTAM	O95727	393 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	APOC2	P02655	101 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	CBSL	P0DN79	551 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	RBP3	P10745	1247 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	ITGAL	P20701	1170 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	CTNNA2	P26232	953 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	CBS	P35520	551 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	PRLHR	P49683	370 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	SLC6A19	Q695T7	634 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	SERPINA9	Q86WD7	417 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF4-262	ENST00000628078	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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