RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613965.1

MFGE8-216, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 5

Gene MFGE8, Length 456 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-216ENST00000613965 PTGIRP43119 386 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 GSDMDP57764 484 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ABRQ12979 859 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SPARCL1Q14515 664 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 GPR33Q49SQ1 333 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ZNF789Q5FWF6 425 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 MICALCLQ6ZW33 695 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SNX20Q7Z614 316 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ATCAYQ86WG3 371 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 TMTC1Q8IUR5 882 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 DSELQ8IZU8 1212 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FAM26EQ8N5C1 309 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ACVR1CQ8NER5 493 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 HEXDCQ8WVB3 486 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 LCN9Q8WX39 176 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 CPT1BQ92523 772 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 LRFN5Q96NI6 719 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 NRTNQ99748 197 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ING2Q9H160 280 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 OR52A5Q9H2C5 316 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SRMSQ9H3Y6 488 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 COG4Q9H9E3 785 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FANCEQ9HB96 536 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 MYO9AB2RTY4 2548 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 GSAPA4D1B5 854 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 BTN3A3O00478 584 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 BTN3A1O00481 513 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 MSL3P1P0C860 447 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PRSS56P0CW18 603 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ST6GAL1P15907 406 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PDHA2P29803 388 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 MC4RP32245 332 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 RORAP35398 523 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PGDP52209 483 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 RWDD2BP57060 319 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 LCN10Q6JVE6 187 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 AADACL2Q6P093 401 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 CLDN19Q8N6F1 224 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 OR1L3Q8NH93 324 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ALG3Q92685 438 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FERD3LQ96RJ6 166 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SLC25A23Q9BV35 468 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 NLNQ9BYT8 704 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 PITPNM3Q9BZ71 974 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 VPS37BQ9H9H4 285 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SYTL2Q9HCH5 934 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 MLXIPLQ9NP71 852 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 ACSS2Q9NR19 701 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 TCFL5Q9UL49 500 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 SNX7Q9UNH6 387 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 DUSP10Q9Y6W6 482 aa9.9□□□□□ -0.82
MFGE8-216ENST00000613965 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.9□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CELSR2Q9HCU4 2923 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 PCSK5Q92824 1860 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 SVILO95425 2214 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 TTLL8A6PVC2 850 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 TMEM150CB9EJG8 249 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 H7C0S8 307 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 TJP3O95049 919 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CAPN1P07384 714 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 RAB40ALP0C0E4 278 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 GP1BBP13224 206 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 PVRP15151 417 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CYP2A7P20853 494 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 ACRV1P26436 265 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CDC25BP30305 580 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 PREPP48147 710 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CD151P48509 253 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 LMAN1P49257 510 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 CCL11P51671 97 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 RPA4Q13156 261 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 NADK2Q4G0N4 442 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
MFGE8-216ENST00000613965 KCTD11Q693B1 232 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms