RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 C5orf34Q96MH7 638 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ERGIC2Q96RQ1 377 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NPHS2Q9NP85 383 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 WASH6PQ9NQA3 447 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 F8P00451 2351 aa8.55□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SEC16AO15027 2179 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR89AB7ZAQ6 455 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.043e-12■■■□□ 14.8
TTR-204ENST00000610404 MATN3O15232 486 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SCRG1O75711 98 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 KRT38O76015 456 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 JCHAINP01591 159 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SLC4A1P02730 911 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CAPN1P07384 714 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR89BP0CG08 455 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PRF1P14222 555 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FUT4P22083 530 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 IDSP22304 550 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CA4P22748 312 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CD86P42081 329 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 DCDC1P59894 354 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PDE1BQ01064 536 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 UBXN1Q04323 297 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GALNT3Q14435 633 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TMEM126BQ8IUX1 230 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LRRC49Q8IUZ0 686 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 D2HGDHQ8N465 521 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TTC30BQ8N4P2 665 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TRAM1L1Q8N609 369 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZBTB2Q8N680 514 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TEKT4Q8WW24 435 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PPM1MQ96MI6 270 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NUP85Q9BW27 656 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NUP62CLQ9H1M0 184 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 GPR83Q9NYM4 423 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TCFL5Q9UL49 500 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SNX7Q9UNH6 387 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SHOC2Q9UQ13 582 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 SCINQ9Y6U3 715 aa8.54□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FBN2P35556 2912 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ANKUB1A6NFN9 424 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TLCD2A6NGC4 264 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LRRC53A6NM62 1247 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 NDUFB5O43674 189 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CDK14O94921 469 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CCDC172P0C7W6 258 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 BPIP17213 487 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ARSEP51690 589 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 VAV2P52735 878 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TUBB4BP68371 445 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 HSD11B2P80365 405 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ID3Q02535 119 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ABRQ12979 859 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 ATP1A4Q13733 1029 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TUBB2AQ13885 445 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 KRT81Q14533 505 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FAM198BQ6UWH4 519 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TMC3Q7Z5M5 1100 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 KMT5CQ86Y97 462 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 IQCKQ8N0W5 287 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 INPP5DQ92835 1189 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FATE1Q969F0 183 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 LRFN5Q96NI6 719 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TSGA13Q96PP4 275 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 CITED4Q96RK1 184 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TRIB3Q96RU7 358 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 TUBB2BQ9BVA1 445 aa8.53□□□□□ -1.04
TTR-204ENST00000610404 HAUS4Q9H6D7 363 aa8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms