RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608369.1

LINC00963-211, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 961 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-211ENST00000608369 INSCQ1MX18 579 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 AMZ1Q400G9 498 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TMEM71Q6P5X7 295 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SRLQ86TD4 932 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 KCNMB4Q86W47 210 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ATCAYQ86WG3 371 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CAMK1DQ8IU85 385 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 NLGN4XQ8N0W4 816 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MPP5Q8N3R9 675 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 AVL9Q8NBF6 648 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ARRDC2Q8TBH0 407 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 LRRN4Q8WUT4 740 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ISL2Q96A47 359 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 EXOC2Q96KP1 924 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CCDC74BQ96LY2 380 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MAGEB18Q96M61 343 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TEX101Q9BY14 249 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 RDH14Q9HBH5 336 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PLAC1Q9HBJ0 212 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TAAR2Q9P1P5 351 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PDP2Q9P2J9 529 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MID2Q9UJV3 735 aa11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 NDUFAB1O14561 156 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PFDN6O15212 129 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 INSIG1O15503 277 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 DUX1O43812 170 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ABCB7O75027 752 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PMPCBO75439 489 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CRTAMO95727 393 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CCL4P13236 92 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 LIFP15018 202 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 FASLGP48023 281 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SERPINB8P50452 374 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CYP4F2P78329 520 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ABHD18Q0P651 414 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 RALGDSQ12967 914 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MAP7Q14244 749 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SKIDA1Q1XH10 827 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 HHATQ5VTY9 493 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CEACAM20Q6UY09 585 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PACS1Q6VY07 963 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 LURAP1LQ8IV03 231 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 BANPQ8N9N5 519 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 OR10G6Q8NH81 332 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 BCAS4Q8TDM0 211 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CKAP2Q8WWK9 683 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SH3KBP1Q96B97 665 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 NUS1Q96E22 293 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 NUDT22Q9BRQ3 303 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 FAM107BQ9H098 131 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 VPS11Q9H270 941 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TREX1Q9NSU2 369 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 KCNK4Q9NYG8 393 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MOSPD1Q9UJG1 213 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 KCTD3Q9Y597 815 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa11.12□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ANKRD36A6QL64 1941 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TRIM49D1C9J1S8 452 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 COPEO14579 308 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 RAD1O60671 282 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 GLRA3O75311 464 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 APOA4P06727 396 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CEACAM5P06731 702 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 MMP2P08253 660 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 SLC2A4P14672 509 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 OR1D5P58170 312 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 DSC2Q02487 901 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 ACVR1Q04771 509 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 DPTQ07507 201 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 KLRB1Q12918 225 aa11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
LINC00963-211ENST00000608369 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms