RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CDC16Q13042 620 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 NME3Q13232 169 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LRP8Q14114 963 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CEBPEQ15744 281 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 PYCR3Q53H96 274 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 IYDQ6PHW0 289 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 BRAT1Q6PJG6 821 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CLEC9AQ6UXN8 241 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SLC35B4Q969S0 331 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TGM7Q96PF1 710 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ALPK1Q96QP1 1244 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 TKTL2Q9H0I9 626 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 VPS16Q9H269 839 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CUEDC2Q9H467 287 aa11.42□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 UCK1Q9HA47 277 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.42□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 CTNND2Q9UQB3 1225 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SH3GLB1Q9Y371 365 aa11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 HIVEP2P31629 2446 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 UNC5CO95185 931 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TEAD1P28347 426 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 CXCR3P49682 368 aa11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 AMPD3Q01432 767 aa11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 MPP3Q13368 585 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 NFIL3Q16649 462 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 BRMS1LQ5PSV4 323 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TMCO4Q5TGY1 634 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ARMC3Q5W041 872 aa11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 DPPA4Q7L190 304 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 LRRC34Q8IZ02 419 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11.41□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 CEP128Q6ZU80 1094 aa11.4□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 ZNF554Q86TJ5 538 aa11.4□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 DSELQ8IZU8 1212 aa11.4□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 NUS1Q96E22 293 aa11.4□□□□□ -0.58
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HCG18-241ENST00000602290 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 TUBB6Q9BUF5 446 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ZYG11BQ9C0D3 744 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 SUV39H2Q9H5I1 410 aa11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
HCG18-241ENST00000602290 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
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