RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589528.1

ACTN4-211, Transcript of actinin alpha 4, humanhuman

TSL 2

Gene ACTN4, Length 441 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4-211ENST00000589528 PCSK5Q92824 1860 aa14.78□□□□□ -0.04
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ACTN4-211ENST00000589528 PROKR1Q8TCW9 393 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTN4-211ENST00000589528 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 50.2
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ACTN4-211ENST00000589528 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
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