RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CYP51A1Q16850 503 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC30A9Q6PML9 568 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IFNEQ86WN2 208 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHX4Q8IUS5 362 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZFAND2BQ8WV99 257 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 USP7Q93009 1102 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD60Q9BZ19 345 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC24A3Q9HC58 644 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8orf4Q9NR00 106 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCL26Q9Y258 94 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RNF11Q9Y3C5 154 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 INPP4BO15327 924 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ULK1O75385 1050 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK16O75716 305 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF15O94989 841 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GSTT1P30711 240 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCR7P32248 378 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GGT5P36269 586 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPL38P63173 70 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PWP1Q13610 501 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GBX1Q14549 363 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IYDQ6PHW0 289 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C9orf16Q9BUW7 83 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRD9Q9H8M2 597 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.17■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LOC730098B7Z3J9 87 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 WASH3PC4AMC7 463 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BNIP3LO60238 219 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR56A5P0C7T3 313 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC2A4P14672 509 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HRH2P25021 359 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.189e-6■□□□□ 10.1
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPINT3P49223 89 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPIAP49247 311 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ATP6AP1Q15904 470 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TMEM25Q86YD3 366 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TFAP2CQ92754 450 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CGREF1Q99674 301 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BEGAINQ9BUH8 593 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLQ9UEF7 1012 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOTCH4Q99466 2003 aa16.16■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM43BA6NCK2 446 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MANBAO00462 879 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCL16O15467 120 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UGT2B4P06133 528 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ACRP10323 421 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C7P10643 843 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NCK1P16333 377 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 AOAHP28039 575 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GNPDA1P46926 289 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EPHA5P54756 1037 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 POLE2P56282 527 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARHGEF7Q14155 803 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RFLNAQ6ZTI6 216 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SPRED1Q7Z699 444 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PLPP6Q8IY26 295 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TCAIMQ8N3R3 496 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KLHL23Q8NBE8 558 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC12A9Q9BXP2 914 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLC32A1Q9H598 525 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PNPLA3Q9NST1 481 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 B4GALT6Q9UBX8 382 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PDE10AQ9Y233 779 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IRAK3Q9Y616 596 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM149AA5PLN7 773 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SAC3D1A6NKF1 404 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DLGAP1O14490 977 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FFAR3O14843 346 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPR42O15529 346 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NUAK1O60285 661 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 C8GP07360 202 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MPC1LP0DKB6 136 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DGKQP52824 942 aa16.15■□□□□ 0.18
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OR4D2P58180 307 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms