RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIMAP7Q8NHV1 300 aa32.3■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CD200R1Q8TD46 325 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FUT8Q9BYC5 575 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 MVB12BQ9H7P6 319 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASF1AQ9Y294 204 aa32.3■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GP5P40197 560 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ERMP1Q7Z2K6 904 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10G6Q8NH81 332 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FERD3LQ96RJ6 166 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC30A3Q99726 388 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPB41L1Q9H4G0 881 aa32.29■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa32.29■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 HES3Q5TGS1 186 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 HECTD2Q5U5R9 776 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT15Q8N3T1 639 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 INPP5DQ92835 1189 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYTH2Q99418 400 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa32.28■■■□□ 2.76
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CTDNEP1-209ENST00000574205 VWA7Q9Y334 891 aa32.28■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDKN2DP55273 166 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMZ1Q400G9 498 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CDCP2Q5VXM1 449 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS12Q86WS5 348 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHC3Q8NDX5 983 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 VPS39Q96JC1 886 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBBP8Q99708 897 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSS3Q9H6R3 686 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC24A2Q9UI40 661 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 V9GYY5 206 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 KNTC1P50748 2209 aa32.27■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUX1O43812 170 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADRB1P08588 477 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXC1Q12948 553 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SQSTM1Q13501 440 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSBG2Q5FVE4 666 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 UNC5DQ6UXZ4 953 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBC1D21Q8IYX1 336 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACVR1CQ8NER5 493 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5K2Q8NHB8 316 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXLNGYQ9BZA5 131 aa32.26■■■□□ 2.76
CTDNEP1-209ENST00000574205 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPNE6O95741 557 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FDXRP22570 491 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD1CP29017 333 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMS2P54278 862 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP32.26■■■□□ 2.754e-7■■■■■ 34.6
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ELMO2Q96JJ3 720 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLCA2Q9UQC9 943 aa32.26■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 D6RAR5 112 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBXN7O94888 489 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-CO3P00414 261 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPN2P04844 631 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBSLP0DN79 551 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBSP35520 551 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABRQ12979 859 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL38Q2WGJ6 581 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRTP1Q5TC63 336 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PIM3Q86V86 326 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR5AR1Q8NGP9 310 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOPNLQ96NB1 174 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLG2Q9UHN1 485 aa32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLDN6P56747 220 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 VSNL1P62760 191 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP9Q49MG5 647 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKAIN2Q5VXU1 208 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR93Q6P2C0 686 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK10Q6ZWH5 1172 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 OLFM1Q99784 485 aa32.24■■■□□ 2.75
CTDNEP1-209ENST00000574205 HGH1Q9BTY7 390 aa32.24■■■□□ 2.75
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