RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561505.2

CLN3-208, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CLN3, Length 495 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-208ENST00000561505 DENND5AQ6IQ26 1287 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 BBS12Q6ZW61 710 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 DET1Q7L5Y6 550 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 DAAM2Q86T65 1068 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CFAP206Q8IYR0 622 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RCOR2Q8IZ40 523 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 NXPE1Q8N323 547 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ULK4Q96C45 1275 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SRMSQ9H3Y6 488 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 DEF6Q9H4E7 631 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 MVB12BQ9H7P6 319 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SPTLC3Q9NUV7 552 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 FKBPLQ9UIM3 349 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SERTAD3Q9UJW9 196 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 HYOU1Q9Y4L1 999 aa15.93■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 BTN3A1O00481 513 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZNF185O15231 689 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 POLBP06746 335 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ATP1A4Q13733 1029 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SSPNQ14714 243 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GPR33Q49SQ1 333 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 NAT14Q8WUY8 206 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 LCN9Q8WX39 176 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CLIP3Q96DZ5 547 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 TCTN2Q96GX1 697 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CCDC42Q96M95 316 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SLC29A3Q9BZD2 475 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 COG4Q9H9E3 785 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SLAMF7Q9NQ25 335 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 EFR3BQ9Y2G0 817 aa15.92■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 POLEQ07864 2286 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 H7C0S8 307 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZNF749O43361 778 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 APOC2P02655 101 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 TPM3P06753 285 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GSTM1P09488 218 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RALBP11234 206 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CYP2A7P20853 494 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 PSMA3P25788 255 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GSTM4Q03013 218 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GSE1Q14687 1217 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 PTCHD3Q3KNS1 767 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ODF2Q5BJF6 829 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 KAZNQ674X7 775 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RHBDD2Q6NTF9 364 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SNX20Q7Z614 316 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 MRGPREQ86SM8 312 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RAB43Q86YS6 212 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 OR52E1Q8NGJ3 308 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 OR13C4Q8NGS5 318 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 COPS8Q99627 209 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 NRTNQ99748 197 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 C17orf62Q9BQA9 187 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 FICDQ9BVA6 458 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 FSD1LQ9BXM9 530 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 LRBAP50851 2863 aa15.91■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 FER1L5A0AVI2 2057 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 C2orf74A8MZ97 194 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 E7EQ34 232 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 LDB2O43679 373 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SPOPO43791 374 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CRTAMO95727 393 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CLDN1O95832 211 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 IGHEP01854 428 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 CD63P08962 238 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 RBL1P28749 1068 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 PDHA2P29803 388 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GCGRP47871 477 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 LMAN1P49257 510 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 MYBPC3Q14896 1274 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 DCAF10Q5QP82 559 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SARM1Q6SZW1 724 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 AMIGO1Q86WK6 493 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 VSTM4Q8IW00 320 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 NACC2Q96BF6 587 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 C19orf60Q96EN9 201 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 DCUN1D1Q96GG9 259 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 SGSM3Q96HU1 749 aa15.9■□□□□ 0.14
CLN3-208ENST00000561505 GBP5Q96PP8 586 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms