RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 ITIH6Q6UXX5 1313 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLIC2O15247 247 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 COQ9O75208 318 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NDST3O95803 873 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 LATS1O95835 1130 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCR5P51681 352 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 AP3M2P53677 418 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVPABLB-1P60509 514 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTKQ06187 659 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 BIRC3Q13489 604 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FHL3Q13643 280 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPPE1Q53F39 396 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAXCQ5TGI0 409 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC9AQ6UXN8 241 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAPRTQ6XQN6 538 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTCHD4Q6ZW05 846 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHST9Q7L1S5 443 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 AADATQ8N5Z0 425 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 C11orf44Q8N8P7 122 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2T34Q8NGX1 318 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 DDI1Q8WTU0 396 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAF4BQ92750 862 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF566Q969W8 418 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIAA1191Q96A73 305 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC39A13Q96H72 371 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MACROD1Q9BQ69 325 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCB8Q9NUT2 735 aa8.6□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 A8MVJ9 347 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM38O00635 465 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CES2O00748 559 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MID1O15344 667 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 STX6O43752 255 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC28A2O43868 658 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV3-27P01718 113 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 HMBSP08397 361 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 GIMD1P0DJR0 217 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 RALAP11233 206 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 P4HA1P13674 534 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CREB1P16220 341 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FPR3P25089 353 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MST1P26927 711 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC5A2P31639 672 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD70P32970 193 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR7P34969 479 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSPA7P48741 367 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSRP3P50461 194 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSG6Q00889 435 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CST6Q15828 149 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPEG1Q2M385 716 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 IQCHQ86VS3 1027 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC28AQ8IWP9 274 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 KDM1BQ8NB78 822 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 GLIS1Q8NBF1 620 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 DUSP16Q9BY84 665 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBXL12Q9NXK8 326 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 U3KQA8 63 aa8.59□□□□□ -1.03
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRP4O75096 1905 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 RP1P56715 2156 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM234BA2RU67 622 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC72A6NJI9 287 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 K7ENP7 123 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLR4O00206 839 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPFIA2O75334 1257 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 MT-CO3P00414 261 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPN1P04843 607 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 EGR1P18146 543 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 DRD3P35462 400 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 HTR3AP46098 478 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABEP1Q15276 862 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPP7Q5T2T1 576 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9orf64Q5T6V5 341 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAP1GAP2Q684P5 730 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 PIGZQ86VD9 579 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 NELFCDQ8IXH7 590 aa8.58□□□□□ -1.04
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A45Q8N413 288 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms