RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559557.1

MRPS11-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S11, human

TSL 3

Gene MRPS11, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS11-208	ENST00000559557	MON1B	Q7L1V2	547 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SYT2	Q8N9I0	419 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MECR	Q9BV79	373 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BRD8	Q9H0E9	1235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF334	Q9HCZ1	680 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PRMT8	Q9NR22	394 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BAG5	Q9UL15	447 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	YIPF1	Q9Y548	306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PCDH15	Q96QU1	1955 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	MTMR11	A4FU01	709 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ANKRD63	C9JTQ0	380 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		K7ENM7	598 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	LAD1	O00515	517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PRRG1	O14668	218 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SYN3	O14994	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ASNA1	O43681	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SOCS5	O75159	536 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PRAMEF12	O95522	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PIGR	P01833	764 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ADRB2	P07550	413 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ATF6	P18850	670 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GNLY	P22749	145 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PRKCH	P24723	683 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	PDLIM4	P50479	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF131	P52739	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TUBA1B	P68363	451 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	BTK	Q06187	659 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TEAD2	Q15562	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557		Q6ZS52	159 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GPBP1	Q86WP2	473 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CLDN23	Q96B33	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FRG2B	Q96QU4	278 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NPAS1	Q99742	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MRPS11-208	ENST00000559557	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	PLXNB3	Q9ULL4	1909 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	PLXNA2	O75051	1894 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557		A0A0B4J293	547 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	AGAP5	A6NIR3	686 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	OGT	O15294	1046 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	CLDN3	O15551	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	HCRT	O43612	131 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	TRAPPC3	O43617	180 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	PTPN2	P17706	415 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	ADSS	P30520	456 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	GDI1	P31150	447 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	RPS9	P46781	194 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MRPS11-208	ENST00000559557	SRSF5	Q13243	272 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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