RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	TAS2R38	P59533	333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF3E	P60228	445 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DSC2	Q02487	901 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MALL	Q13021	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX1	Q13596	522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPRR	Q15256	657 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RPS6KA1	Q15418	735 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	UGP2	Q16851	508 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KIF19	Q2TAC6	998 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FAXC	Q5TGI0	409 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		Q6ZSR6	202 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PTAR1	Q7Z6K3	402 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM139	Q8IV31	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MINDY1	Q8N5J2	469 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	EXD1	Q8NHP7	514 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	JADE3	Q92613	823 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LRIG1	Q96JA1	1093 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF599	Q96NL3	588 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF670	Q9BS34	389 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC32A1	Q9H598	525 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IL21R	Q9HBE5	538 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PDF	Q9HBH1	243 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NOD2	Q9HC29	1040 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL8	Q9P2G9	620 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PCDHA3	Q9Y5H8	950 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288		A0A0U1RQS6	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MUSK	O15146	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNN4	O15554	427 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN12	O43309	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SH3BP5	O60239	455 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CEP104	O60308	925 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SDC3	O75056	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CER1	O95813	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	WNT1	P04628	370 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PCCB	P05166	539 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HLA-DQB2	P05538	268 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ALPI	P09923	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ELFN1	P0C7U0	828 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CTSE	P14091	401 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF20	P17024	532 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TGM2	P21980	687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	TGM1	P22735	817 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CA4	P22748	312 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	CSNK1D	P48730	415 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NR2C2	P49116	596 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	LMAN1	P49257	510 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	SELENOP	P49908	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	AP1S1	P61966	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT2	Q10471	571 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GRIK2	Q13002	908 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	GALNT3	Q14435	633 aa		4.64	□□□□□ -1.67
ATXN3-238	ENST00000556288	PRPSAP1	Q14558	356 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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