RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552295.5

BEST3-211, Transcript of bestrophin 3, humanhuman

TSL 5

Gene BEST3, Length 720 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST3-211ENST00000552295 TBK1Q9UHD2 729 aa7.96□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.96□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.96□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3EA0A087X179 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 A0A1W2PQU0 124 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PRR23AA6NEV1 266 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 FAM47DPA6NHR8 397 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 LRRC72A6NJI9 287 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 NUDT19A8MXV4 375 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3LB9A6J9 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 OPA1O60313 960 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ZNF217O75362 1048 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 HAUS5O94927 633 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ITGA2BP08514 1039 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 MYZAPP0CAP1 466 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PRKCAP17252 672 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ACRV1P26436 265 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SPRP35270 261 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CD151P48509 253 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TTPAP49638 278 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SERPINB9P50453 376 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CCR3P51677 355 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CLCN5P51795 746 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ITGA9Q13797 1035 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 BMPR2Q13873 1038 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 WSCD2Q2TBF2 565 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ZNF284Q2VY69 593 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TTMPQ5BVD1 217 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CERS6Q6ZMG9 384 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TAS2R42Q7RTR8 314 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SERPINA9Q86WD7 417 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TRIM69Q86WT6 500 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 NXPE1Q8N323 547 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 FRMD1Q8N878 549 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SYT8Q8NBV8 401 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 OR2T34Q8NGX1 318 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 RLN3Q8WXF3 142 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 LPGAT1Q92604 370 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 KLK6Q92876 244 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ULK4Q96C45 1275 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TLCD1Q96CP7 247 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 VPS39Q96JC1 886 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 VPS35Q96QK1 796 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 GPR22Q99680 433 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SLC17A9Q9BYT1 436 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 BTBD1Q9H0C5 482 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CENPHQ9H3R5 247 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CRLS1Q9UJA2 301 aa7.95□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TRIM49D1C9J1S8 452 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 H3BQF6 201 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 K7ESM1 405 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 RAD51BO15315 384 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 LATO43561 262 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 OR1I1O60431 355 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 NDUFS3O75489 264 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 KRT37O76014 449 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 KRT38O76015 456 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SEMA4FO95754 770 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 TDGF1P13385 188 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CNTFP26441 200 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PMLP29590 882 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CD6P30203 668 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 OXTRP30559 389 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 HOXA6P31267 233 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 CCNFP41002 786 aa7.94□□□□□ -1.14
BEST3-211ENST00000552295 PTGER3P43115 390 aa7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms