RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NTNG1	Q9Y2I2	539 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	C2orf81	A6NN90	581 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	AP3B1	O00203	1094 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DNALI1	O14645	258 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	INPP4B	O15327	924 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZW10	O43264	779 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SNX2	O60749	519 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SPAG6	O75602	509 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CRTAM	O95727	393 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SOD1	P00441	154 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SLC4A1	P02730	911 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CTAGE8	P0CG41	777 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BPI	P17213	487 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LPO	P22079	712 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FASLG	P48023	281 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DCDC1	P59894	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PDE1B	Q01064	536 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MAP7	Q14244	749 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	POU6F1	Q14863	301 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PYCR3	Q53H96	274 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RAET1G	Q6H3X3	334 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF534	Q76KX8	674 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HOOK3	Q86VS8	718 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MCU	Q8NE86	351 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MOCOS	Q96EN8	888 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TGM7	Q96PF1	710 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ERP44	Q9BS26	406 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ABCG8	Q9H221	673 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IGF2BP1	Q9NZI8	577 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ARL5A	Q9Y689	179 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MROH6	A6NGR9	719 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MASP2	O00187	686 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TP73	O15350	636 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LDB2	O43679	373 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MLN	P12872	115 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PPP1CA	P62136	330 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SARNP	P82979	210 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	KCNAB1	Q14722	419 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DUPD1	Q68J44	220 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LCN10	Q6JVE6	187 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PCGF5	Q86SE9	256 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	CEP112	Q8N8E3	955 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	GPR26	Q8NDV2	337 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SCAMP4	Q969E2	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	AP2M1	Q96CW1	435 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SNF8	Q96H20	258 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	DPYSL5	Q9BPU6	564 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PKP3	Q9Y446	797 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZG16	O60844	167 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	IVL	P07476	585 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PSMA3	P25788	255 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	TEAD1	P28347	426 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MAGEA3	P43357	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NPY2R	P49146	381 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LAMB3	Q13751	1172 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	MORF4L2	Q15014	288 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	C8orf74	Q6P047	294 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	INPP5D	Q92835	1189 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	POM121	Q96HA1	1249 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	C9orf72	Q96LT7	481 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	SERPINB12	Q96P63	405 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		13.49	□□□□□ -0.25
CS-231	ENST00000552222	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25

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