RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf27AQ580R0 203 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SZRD1Q7Z422 152 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPR135Q8IZ08 494 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.22□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 IL1BP01584 269 aa6.21□□□□□ -1.42
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PTPRB-210ENST00000551525 NDUFS1P28331 727 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 TYK2P29597 1187 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ARL2P36404 184 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B3P37058 310 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 NRIP1P48552 1158 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 VEGFCP49767 419 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 ABRQ12979 859 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 GRIK5Q16478 980 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRB-210ENST00000551525 PARP15Q460N3 678 aa6.21□□□□□ -1.42
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