RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551137.5

CS-223, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-223	ENST00000551137	OR8K5	Q8NH50	307 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SRMS	Q9H3Y6	488 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GPN2	Q9H9Y4	310 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TREX1	Q9NSU2	369 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR51F1	A6NGY5	319 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	SPTB	P11277	2137 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FOLR1	P15328	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KCNJ1	P48048	391 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TUBB4B	P68371	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRKAA1	Q13131	559 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TUBB3	Q13509	450 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KRT33B	Q14525	404 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MPP5	Q8N3R9	675 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LCN9	Q8WX39	176 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	EXTL1	Q92935	676 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PBK	Q96KB5	322 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	POLG2	Q9UHN1	485 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CCDC78	A2IDD5	438 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137		B8ZZF3	427 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BTN3A3	O00478	584 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR1I1	O60431	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GPC4	O75487	556 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ITGB6	P18564	788 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CXCR5	P32302	372 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PREP	P48147	710 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TTPA	P49638	278 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	CYP4F2	P78329	520 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PRAME	P78395	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	BORA	Q6PGQ7	559 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PHC3	Q8NDX5	983 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ELMO1	Q92556	727 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	WDR70	Q9NW82	654 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PADI1	Q9ULC6	663 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-223	ENST00000551137	C21orf140	B9A014	251 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	PRMT5	O14744	637 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	NKX2-8	O15522	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	TIAF1	O95411	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	1e-6	■■■■□ 26.3
CS-223	ENST00000551137	CCR7	P32248	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-223	ENST00000551137	SHMT2	P34897	504 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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