RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TRIM14Q14142 442 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 NCF4Q15080 339 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 KYNUQ16719 465 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 TFDP3Q5H9I0 405 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 RAB43Q86YS6 212 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C19orf60Q96EN9 201 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 13.5
CS-214ENST00000548849 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 APOL2Q9BQE5 337 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ABHD10Q9NUJ1 306 aa16.49■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C5orf60A6NFR6 353 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C9J4A7 227 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 H7C0C1 242 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 BTN3A1O00481 513 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ZNF749O43361 778 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PSTPIP1O43586 416 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 KRT86O43790 486 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ANXA9O76027 345 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 TPM1P09493 284 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PVRP15151 417 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 RBL1P28749 1068 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ATP5OP48047 213 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PRLHRP49683 370 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 XIAPP98170 497 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 MLIPQ5VWP3 458 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PHC3Q8NDX5 983 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ULK4Q96C45 1275 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 COPS8Q99627 209 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 NRTNQ99748 197 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 FAM96AQ9H5X1 160 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PADI2Q9Y2J8 665 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ALG6Q9Y672 507 aa16.48■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 UNC79Q9P2D8 2635 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CFAP99D6REC4 459 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CRTAMO95727 393 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 HBQ1P09105 142 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 MSL3P1P0C860 447 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 COL8A1P27658 744 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 OLIG2Q13516 323 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 NR6A1Q15406 480 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 RANBP10Q6VN20 620 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 HOOK3Q86VS8 718 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 GPR135Q8IZ08 494 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 RCOR2Q8IZ40 523 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 OR13C4Q8NGS5 318 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 DHRS4Q9BTZ2 278 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PITPNM3Q9BZ71 974 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 GBA3Q9H227 469 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 XKR8Q9H6D3 395 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 COG4Q9H9E3 785 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C5AR2Q9P296 337 aa16.47■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 AGAP14A8MT82 685 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 C2orf74A8MZ97 194 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CBFA2T2O43439 604 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 LDB2O43679 373 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ITGALP20701 1170 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PRKG2Q13237 762 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 SSPNQ14714 243 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 TCEAL1Q15170 157 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ZNF787Q6DD87 383 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 SARM1Q6SZW1 724 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 SNX20Q7Z614 316 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 AMIGO1Q86WK6 493 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 KATNAL2Q8IYT4 538 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 IQCKQ8N0W5 287 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 NXPE1Q8N323 547 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 FERMT1Q9BQL6 677 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 GORASP1Q9BQQ3 440 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 OR52A5Q9H2C5 316 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 ACTR10Q9NZ32 417 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 INTUQ9ULD6 942 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
CS-214ENST00000548849 PDHA2P29803 388 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-214ENST00000548849 ADRA1AP35348 466 aa16.45■□□□□ 0.22
CS-214ENST00000548849 HADHAP40939 763 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms