RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 WDR48Q8TAF3 677 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CD200R1Q8TD46 325 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM136AQ96C01 138 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ELMO2Q96JJ3 720 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC38A3Q99624 504 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC30A3Q99726 388 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC3Q9BQI4 270 aa16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EPHA4P54764 986 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 POU4F1Q01851 419 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PPM1JQ5JR12 505 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EMBQ6PCB8 327 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SPRED1Q7Z699 444 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC44A1Q8WWI5 657 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR22Q99680 433 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 B4GAT1O43505 415 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OPA1O60313 960 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RPN2P04844 631 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MPC1LP0DKB6 136 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MAPK9P45984 424 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TAS2R39P59534 338 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GPLD1P80108 840 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SQSTM1Q13501 440 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 KRT33BQ14525 404 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC29A2Q14542 456 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ACSBG2Q5FVE4 666 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ACVR1CQ8NER5 493 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OR5K2Q8NHB8 316 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FERD3LQ96RJ6 166 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OLFM1Q99784 485 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 LRRN3Q9H3W5 708 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 POPDC3Q9HBV1 291 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 KCNK4Q9NYG8 393 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FETUBQ9UGM5 382 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 POLG2Q9UHN1 485 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ASF1AQ9Y294 204 aa16.04■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM155BO75949 473 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MATN4O95460 622 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ITGA2BP08514 1039 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ALDH4A1P30038 563 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RGS4P49798 205 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OR1D5P58170 312 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ABRQ12979 859 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 GPR18Q14330 331 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PAQR3Q6TCH7 311 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CYHR1Q6ZMK1 362 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PIM3Q86V86 326 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PHC3Q8NDX5 983 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CAVIN3Q969G5 261 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 FOPNLQ96NB1 174 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ABCG4Q9H172 646 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC24A2Q9UI40 661 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF180Q9UJW8 692 aa16.03■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1W2PQM1 296 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 TCEA3O75764 348 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 INHBAP08476 426 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 MSH2P43246 934 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SERPINB9P50453 376 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC12A2P55011 1212 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 IL2P60568 153 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CCL7P80098 99 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CCDC157Q569K6 752 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CNPY4Q8N129 248 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OR5AR1Q8NGP9 310 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 OR10G6Q8NH81 332 aa16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
PACSIN3-210ENST00000533686 PAFAH2Q99487 392 aa16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms