RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531908.5

RPS13-208, Transcript of ribosomal protein S13, human

TSL 2

Gene RPS13, Length 746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS13-208	ENST00000531908	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	APBB2	Q92870	758 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CDCA5	Q96FF9	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM19	Q96HH6	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	QRFPR	Q96P65	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SDF4	Q9BRK5	362 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C1QTNF1	Q9BXJ1	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CLIC4	Q9Y696	253 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SLC16A5	O15375	505 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TSPAN9	O75954	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MMP1	P03956	469 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CMA1	P23946	247 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MCM3	P25205	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CLCN3	P51790	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R40	P59535	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TRIM29	Q14134	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	WDR78	Q5VTH9	848 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IRAK1BP1	Q5VVH5	260 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CHST9	Q7L1S5	443 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	OR8K5	Q8NH50	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FIG4	Q92562	907 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CMKLR1	Q99788	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MXD3	Q9BW11	206 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	VPS33B	Q9H267	617 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TSPY26P	Q9H489	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	COPG2	Q9UBF2	871 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	STK39	Q9UEW8	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FLT1	P17948	1338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908		A0A0G2JPF8	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CTAGE5	O15320	804 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	RB1	P06400	928 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CLTB	P09497	229 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LINC00271	P0C7V0	271 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	KIF5B	P33176	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	USP8	P40818	1118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	PDLIM4	P50479	330 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TAS2R38	P59533	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CAMK4	Q16566	473 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DECR1	Q16698	335 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	JADE1	Q6IE81	842 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TEKT1	Q969V4	418 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RPS13-208	ENST00000531908	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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