RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 CACNA1EQ15878 2313 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 B4DGG1 531 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTM1P09488 218 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ACADLP28330 430 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DPP6P42658 865 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 BDKRB1P46663 353 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 GSTM4Q03013 218 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOCQ15369 112 aa22.21■■□□□ 1.15
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TSNARE1-208ENST00000524325 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 EMCNQ9ULC0 261 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 ACSL5Q9ULC5 683 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 DOLKQ9UPQ8 538 aa22.21■■□□□ 1.15
TSNARE1-208ENST00000524325 A0A1B0GTQ1 180 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LNP1A1A4G5 178 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CBSLP0DN79 551 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CBSP35520 551 aa22.2■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 PHKG1Q16816 387 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF423Q2M1K9 1284 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PDZD3Q86UT5 571 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TCP10LQ8TDR4 215 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TFGQ92734 400 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CABS1Q96KC9 395 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PI4KAP42356 2102 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FANCMQ8IYD8 2048 aa22.2■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 A6NCN8 305 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TK2O00142 265 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TYROBPO43914 113 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MYF5P13349 255 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 RXRGP48443 463 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 RPA4Q13156 261 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ASB11Q8WXH4 323 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SELENOSQ9BQE4 189 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ASF1AQ9Y294 204 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 CRHR1P34998 444 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NBL1P41271 181 aa22.19■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 RPE65Q16518 533 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 HSP90B2PQ58FF3 399 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD42Q8N9B4 389 aa22.19■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 XPR1Q9UBH6 696 aa22.19■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LRP4O75096 1905 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNJ13O60928 360 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MATN4O95460 622 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LMNAP02545 664 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SYPP08247 313 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SBSNQ6UWP8 590 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.18■■□□□ 1.14
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TSNARE1-208ENST00000524325 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TSNARE1Q96NA8 513 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 DCDC2Q9UHG0 476 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 PLAGL1Q9UM63 463 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SPEGQ15772 3267 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM120BA0PK00 339 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 KLHL33A6NCF5 533 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGEF33A8MVX0 844 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LMO7DNF2Z398 122 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SBK3P0C264 359 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GIMD1P0DJR0 217 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MPC1LP0DKB6 136 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 F3P13726 295 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC26A3P40879 764 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 LVRNQ6Q4G3 990 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 GKN2Q86XP6 184 aa22.18■■□□□ 1.14
TSNARE1-208ENST00000524325 MGARPQ8TDB4 240 aa22.18■■□□□ 1.14
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