RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VTNP04004 478 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 H1F0P07305 194 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM200BP0CF97 657 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDHA2P29803 388 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF667Q5HYK9 610 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PAMR1Q6UXH9 720 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RNF130Q86XS8 419 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GCSAMQ8N6F7 178 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USP38Q8NB14 1042 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLC38A9Q8NBW4 561 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C11orf65Q8NCR3 313 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GATAD1Q8WUU5 269 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NSMAFQ92636 917 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GCC1Q96CN9 775 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PIP5K1AQ99755 562 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OBP2AQ9NY56 170 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STK39Q9UEW8 545 aa0.3□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VWA3AA6NCI4 1184 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6CA6NDK9 693 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6BA6NDN3 693 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SERPINE3A8MV23 424 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 K7ENM7 598 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANP32CO43423 234 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPAN6O43657 245 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 B4GALT2O60909 372 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGKV1D-16P01601 117 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6DP0CG33 693 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VDRP11473 427 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CA4P22748 312 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PMELP40967 661 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRELPP51888 382 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 BTKQ06187 659 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NAA25Q14CX7 972 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 COL28A1Q2UY09 1125 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GFOD2Q3B7J2 385 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LIN54Q6MZP7 749 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LCLAT1Q6UWP7 414 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM139Q8IV31 216 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYTL1Q8IYJ3 562 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EMC1Q8N766 993 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF540Q8NDQ6 660 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6Y1Q8NGX8 325 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SIPA1Q96FS4 1042 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD180Q99467 661 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEMA3CQ99985 751 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM47Q9BQJ4 181 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OVOL2Q9BRP0 275 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OBP2BQ9NPH6 170 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR14J1Q9UGF5 321 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 UTYO14607 1347 aa0.29□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LGALS16A8MUM7 142 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PMM2O15305 246 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SEC24AO95486 1093 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RENP00797 406 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GALTP07902 379 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOXB5P09067 269 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF44P15621 663 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFAIP3P21580 790 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ELK3P41970 407 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GABRB2P47870 512 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPECC1Q5M775 1068 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FAM83BQ5T0W9 1011 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AGBL2Q5U5Z8 902 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C10orf90Q96M02 699 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EYA3Q99504 573 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MROH8Q9H579 483 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ALKBH4Q9NXW9 302 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR6C2Q9NZP2 312 aa0.28□□□□□ -2.36
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR2M5A3KFT3 312 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STX16O14662 325 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPC4O75487 556 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CEACAM4O75871 244 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CD81P60033 236 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSNK2BP67870 215 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 HOMEZQ8IX15 550 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OR1J2Q8NGS2 313 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SGK494Q96LW2 274 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NECTIN4Q96NY8 510 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF670Q9BS34 389 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CCSER1Q9C0I3 900 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARFGAP3Q9NP61 516 aa0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP0.27□□□□□ -2.37
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C20orf141Q9NUB4 165 aa0.27□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms