RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.7□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 A0A0G2JMP0 313 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PP18 115 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ACOD1A6NK06 481 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 G3V2T6 193 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PLK4O00444 970 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 AP2A1O95782 977 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35E2BP0CK96 405 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IL7RP16871 459 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IL1RNP18510 177 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HLA-DMAP28067 261 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35A2P78381 396 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LIPEQ05469 1076 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CDK5R2Q13319 367 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 MEP1AQ16819 746 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PARP15Q460N3 678 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IQCCQ4KMZ1 466 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DENND5AQ6IQ26 1287 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TBPL2Q6SJ96 375 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LAYNQ6UX15 382 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 OR5B17Q8NGF7 314 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CPB2Q96IY4 423 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PHOX2BQ99453 314 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 XPR1Q9UBH6 696 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DNMT3LQ9UJW3 386 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC39A10Q9ULF5 831 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 USP22Q9UPT9 525 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 A0A075B6Q4 140 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PQLC2LA1A4F0 135 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LINC00862A6NCI5 91 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PRR23AA6NEV1 266 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HBQ1P09105 142 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CD19P15391 556 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SDC4P31431 198 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HTR2BP41595 481 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ASPAP45381 313 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RPIAP49247 311 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DCDC1P59894 354 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 EMX2Q04743 252 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 DMC1Q14565 340 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 AANATQ16613 207 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 BBS7Q8IWZ6 715 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FNDC5Q8NAU1 212 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 OR10T2Q8NGX3 314 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 OR5K1Q8NHB7 308 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CCDC115Q96NT0 180 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LUZP4Q9P127 313 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 EGFL7Q9UHF1 273 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 FAM92AA1XBS5 289 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 C12orf71A8MTZ7 269 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RGS10O43665 173 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 F9P00740 461 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CYP11A1P05108 521 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ACADMP11310 421 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM11P17152 192 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 RAB25P57735 213 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SGCGQ13326 291 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 PLD1Q13393 1074 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 GRM3Q14832 879 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 IMPG1Q17R60 797 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF699Q32M78 642 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 COLEC12Q5KU26 742 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TSTD2Q5T7W7 516 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC6A19Q695T7 634 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 TMIEQ8NEW7 156 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 KLHL6Q8WZ60 621 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 SLC7A6Q92536 515 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 COL26A1Q96A83 441 aa8.69□□□□□ -1.02
GPBP1-208ENST00000514387 L3HYPDHQ96EM0 354 aa8.69□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms