RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLHL35	Q6PF15	583 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OOSP2	Q86WS3	158 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	VRK3	Q8IV63	474 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	D2HGDH	Q8N465	521 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELMO1	Q92556	727 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	EXTL1	Q92935	676 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PBK	Q96KB5	322 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	FERD3L	Q96RJ6	166 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIFC1	Q9BW19	673 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	AP1M1	Q9BXS5	423 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL22	Q9GZX6	179 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TFB2M	Q9H5Q4	396 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYBU	Q9NX95	663 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL17B	Q9UHF5	180 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ICK	Q9UPZ9	632 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	IQCF5	A8MTL0	148 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	QSOX1	O00391	747 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTN3A1	O00481	513 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	AVIL	O75366	819 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIAA0754	O94854	1291 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CCR7	P32248	378 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPY2R	P49146	381 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	VPS41	P49754	854 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRAME	P78395	509 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDK16	Q00536	496 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRKG2	Q13237	762 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	BRD3	Q15059	726 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBR1	Q16650	682 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CES3	Q6UWW8	571 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	KMT5C	Q86Y97	462 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MPP5	Q8N3R9	675 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCN9	Q8WX39	176 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CPT1B	Q92523	772 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MFSD3	Q96ES6	412 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	HGH1	Q9BTY7	390 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	P2RY12	Q9H244	342 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	XKR8	Q9H6D3	395 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	MRM3	Q9HC36	420 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	BTRC	Q9Y297	605 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SH3BP2-222	ENST00000512014	USP27X	A6NNY8	438 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF185	O15231	689 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKX2-8	O15522	239 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRDC	O43847	1150 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPC4	O75487	556 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT14	P02533	472 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FTH1	P02794	183 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGB2	P05107	769 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR56A5	P0C7T3	313 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ITGB6	P18564	788 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRDX3	P30048	256 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TERF1	P54274	439 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSD11B2	P80365	405 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	GPS1	Q13098	491 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TUBB3	Q13509	450 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARF	Q8N187	725 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRT222	Q8N1A0	295 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44	5e-14	■■■□□ 16
SH3BP2-222	ENST00000512014	ESX1	Q8N693	406 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	12.33	□□□□□ -0.44	2e-6	■■■■■ 54.9
SH3BP2-222	ENST00000512014	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	MENT	Q9BUN1	341 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	CARD6	Q9BX69	1037 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SH3BP2-222	ENST00000512014	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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