RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	ALG9	Q9H6U8	611 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SLC17A7	Q9P2U7	560 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		27.89	■■■□□ 2.06
TTC19-208	ENST00000497842	CDC7	O00311	574 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	IFRD1	O00458	451 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PLIN3	O60664	434 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ACTR1B	P42025	376 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ACTR1A	P61163	376 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	MPP2	Q14168	576 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ELOC	Q15369	112 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PTER	Q96BW5	349 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	WWP1	Q9H0M0	922 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SPAST	Q9UBP0	616 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	MID2	Q9UJV3	735 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	EMCN	Q9ULC0	261 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CACNA1E	Q15878	2313 aa		27.88	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	EPN2	O95208	641 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	MATN4	O95460	622 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PROC	P04070	461 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SP140	Q13342	867 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TCEA2	Q15560	299 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TAF8	Q7Z7C8	310 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC63	Q8NA47	563 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ASB11	Q8WXH4	323 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC61	Q9BV99	259 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	XPR1	Q9UBH6	696 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	RNF112	Q9ULX5	631 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		27.87	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SLC16A5	O15375	505 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SNX2	O60749	519 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	HAL	P42357	657 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	OR4D1	Q15615	310 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	NRROS	Q86YC3	692 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	RDH11	Q8TC12	318 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SYCE1L	A8MT33	242 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	KERA	O60938	352 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ACADL	P28330	430 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	IRX4	P78413	519 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	BNC1	Q01954	994 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	HHAT	Q5VTY9	493 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	GPSM1	Q86YR5	675 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	DENND1A	Q8TEH3	1009 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	RMDN2	Q96LZ7	410 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		27.86	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	GFY	I3L273	518 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TK2	O00142	265 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	RPN2	P04844	631 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CYP2A7	P20853	494 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	GKN2	Q86XP6	184 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	MGARP	Q8TDB4	240 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PARVB	Q9HBI1	364 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	CAPN10	Q9HC96	672 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		27.85	■■■□□ 2.05
TTC19-208	ENST00000497842	KNL1	Q8NG31	2342 aa		27.84	■■■□□ 2.05

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