RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GDAP1	Q8TB36	358 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ISL2	Q96A47	359 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC25	Q96NG3	672 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP3K3	Q99759	626 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM7	Q9C029	511 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB33B	Q9H082	229 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCE	Q9HB96	536 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KCND1	Q9NSA2	647 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL26L1	Q9UNX3	145 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CEACAM4	O75871	244 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	JCHAIN	P01591	159 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PCK1	P35558	622 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRB	P48167	497 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB4B	P68371	445 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN1	Q04323	297 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GPS2	Q13227	327 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB2A	Q13885	445 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR19	Q15760	415 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB43	Q86YS6	212 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX26	Q8N6G2	289 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8K5	Q8NH50	307 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CPT1B	Q92523	772 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TM9SF4	Q92544	642 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GLYATL1	Q969I3	302 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LYSMD1	Q96S90	227 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TCFL5	Q9UL49	500 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SHOC2	Q9UQ13	582 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TLCD2	A6NGC4	264 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CHUK	O15111	745 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MATN3	O15232	486 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	VEGFD	O43915	354 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT38	O76015	456 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PRL	P01236	227 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	BRAF	P15056	766 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IL1R2	P27930	398 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OTX2	P32243	289 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	XRCC4	Q13426	336 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP1A4	Q13733	1029 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GALNT3	Q14435	633 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CT47A1	Q5JQC4	288 aa	Predicted RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PDPK2P	Q6A1A2	396 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	OOSP2	Q86WS3	158 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CD180	Q99467	661 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	NUP85	Q9BW27	656 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	NLN	Q9BYT8	704 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	IMP3	Q9NV31	184 aa	Known RBP	10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	C5AR2	Q9P296	337 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LRBA	P50851	2863 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511		C9J4A7	227 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX12	O00623	359 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRTM2	O43300	516 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD11	O43934	449 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	KLHL41	O60662	606 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	HLA-DQB2	P05538	268 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	PIRT	P0C851	137 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CYP2A7	P20853	494 aa		10.55	□□□□□ -0.72
SKAP2-209	ENST00000497511	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	10.55	□□□□□ -0.72

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