RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 GGT5P36269 586 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CXCL12P48061 93 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CDKL1Q00532 357 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GSTM4Q03013 218 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ABRQ12979 859 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GTF2H3Q13889 308 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GRB7Q14451 532 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 NFATC4Q14934 902 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 UGT3A2Q3SY77 523 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CDKL4Q5MAI5 379 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 METRNLQ641Q3 311 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SPATA21Q7Z572 469 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CPLX4Q7Z7G2 160 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 LRRTM4Q86VH4 590 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 MAPK15Q8TD08 544 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CCDC126Q96EE4 140 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 DPEP2Q9H4A9 486 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 RMI1Q9H9A7 625 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PARVBQ9HBI1 364 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 KLC4Q9NSK0 619 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PCTPQ9UKL6 214 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 WDR37Q9Y2I8 494 aa9.2□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 DMDP11532 3685 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ATG2BQ96BY7 2078 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 A0A1W2PR77 199 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM233B4DJY2 109 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 MATN2O00339 956 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 FPGTO14772 594 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 KMOO15229 486 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PRAMEF4O60810 478 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SUPT7LO94864 414 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GUCA1CO95843 209 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 JUNP05412 331 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GFAPP14136 432 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 AOC1P19801 751 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 HOXA6P31267 233 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 AKT2P31751 481 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SERPINB5P36952 375 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 GDF5P43026 501 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SLC6A12P48065 614 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 RPIAP49247 311 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 YPEL5P62699 121 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SH3BP2P78314 561 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 RPA4Q13156 261 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SP140Q13342 867 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TUBB3Q13509 450 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TSSK4Q6SA08 328 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 Q6ZSR6 202 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 AMZ2Q86W34 360 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CRLF3Q8IUI8 442 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 DEFB119Q8N690 84 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CCNYL1Q8N7R7 359 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ANKS4BQ8N8V4 417 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 OR13H1Q8NG92 308 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 OR56A4Q8NGH8 313 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 CCL4L1Q8NHW4 92 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TMEM159Q96B96 161 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 RMDN2Q96LZ7 410 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SLC6A18Q96N87 628 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PKP4Q99569 1192 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 NRTNQ99748 197 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 EBF4Q9BQW3 602 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TIMM29Q9BSF4 260 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 IER2Q9BTL4 223 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 MENTQ9BUN1 341 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 NPHS2Q9NP85 383 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 KLF15Q9UIH9 416 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 TMCO1Q9UM00 188 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 DMTF1Q9Y222 760 aa9.19□□□□□ -0.94
SEC22C-216ENST00000493107 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms