RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP13.26□□□□□ -0.292e-6■□□□□ 11.2
NISCH-212ENST00000488380 KCTD3Q9Y597 815 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 BCKDKO14874 412 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PEX11BO96011 259 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 HOXC13P31276 330 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 S100A5P33763 92 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CD86P42081 329 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 FKBP1BP68106 108 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 DSC2Q02487 901 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CDK5R2Q13319 367 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PTPRCAPQ14761 206 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZFP69Q49AA0 526 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LAIR2Q6ISS4 152 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ISCA2Q86U28 154 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 HMCESQ96FZ2 354 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CLSTN3Q9BQT9 956 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RHNO1Q9BSD3 238 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TBCDQ9BTW9 1192 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SCN3BQ9NY72 215 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ASPDHA6ND91 283 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TULP3O75386 442 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 DNAJB5O75953 348 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MATN4O95460 622 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GOT2P00505 430 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 HTR1EP28566 365 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GEMP55040 296 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 EPS8Q12929 822 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TUSC3Q13454 348 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RAPSNQ13702 412 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LAPTM4AQ15012 233 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF404Q494X3 552 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NUDT8Q8WV74 236 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 B3GALT6Q96L58 329 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CITED4Q96RK1 184 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RIBC2Q9H4K1 309 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GABRQQ9UN88 632 aa13.26□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 A0A0U1RQF3 1178 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PRKCAP17252 672 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ARSDP51689 593 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SELPLGQ14242 412 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CRY1Q16526 586 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NCLNQ969V3 563 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 GPR45Q9Y5Y3 372 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 A0A1B0GTL3 188 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 SAGE2PA6NJ88 616 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TBKBP1A7MCY6 615 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MITFO75030 526 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ASGR1P07306 291 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 HMBSP08397 361 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 KRT6CP48668 564 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 OR2B6P58173 313 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF181Q2M3W8 571 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 WDR45BQ5MNZ6 344 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 BRMS1LQ5PSV4 323 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NEK5Q6P3R8 708 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 KDELC1Q6UW63 502 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 NEK10Q6ZWH5 1172 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LACC1Q8IV20 430 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 HID1Q8IV36 788 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 METTL4Q8N3J2 472 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TMEM199Q8N511 208 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 FNDC5Q8NAU1 212 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PTERQ96BW5 349 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ACOX2Q99424 681 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 UGT2B28Q9BY64 529 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 TPRKBQ9Y3C4 175 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 PATJQ8NI35 1801 aa13.25□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 MT-ND2P03891 347 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 CDKN2DP55273 166 aa13.24□□□□□ -0.29
NISCH-212ENST00000488380 RCAN2Q14206 197 aa13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms