RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PAQR3Q6TCH7 311 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CRTC3Q6UUV7 619 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SH2D5Q6ZV89 423 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 MICALCLQ6ZW33 695 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 PROSER1Q86XN7 944 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 GKN2Q86XP6 184 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CEP97Q8IW35 865 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CFAP206Q8IYR0 622 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SLC22A15Q8IZD6 547 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 KRT222Q8N1A0 295 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 PNPLA1Q8N8W4 532 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 PHC3Q8NDX5 983 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 RHEBL1Q8TAI7 183 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 PDXPQ96GD0 296 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CAB39LQ9H9S4 337 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 CAPN10Q9HC96 672 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 KLC4Q9NSK0 619 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 DNAJC28Q9NX36 388 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 MID2Q9UJV3 735 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GVT2 93 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 A0A1W2PPM1 405 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NEMP2A6NFY4 417 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 COPEO14579 308 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KDM1AO60341 852 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CER1O95813 267 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 C8GP07360 202 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CCDC166P0CW27 439 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PYGBP11216 843 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACP5P13686 325 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 NDUFS1P28331 727 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HALP42357 657 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CTBSQ01459 385 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HSPA14Q0VDF9 509 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CCDC153Q494R4 210 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TPRG1LQ5T0D9 272 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 UNC5DQ6UXZ4 953 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CMC1Q7Z7K0 106 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PIP4P1Q86T03 277 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CLEC14AQ86T13 490 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 APOPT1Q96IL0 206 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 VPS11Q9H270 941 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TMCO1Q9UM00 188 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CDYLQ9Y232 598 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 IGSF10Q6WRI0 2623 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 FREM2Q5SZK8 3169 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 A0A0G2JNG1 304 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SYCE1LA8MT33 242 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP33O14559 1287 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TM9SF1O15321 606 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 MATN4O95460 622 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TSPAN12O95859 305 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SYF2O95926 243 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CAPNS1P04632 268 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 SLC35G4P0C7Q5 338 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ZNF883P0CG24 379 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 ITGB6P18564 788 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KIR2DS5Q14953 304 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KIF19Q2TAC6 998 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 COL28A1Q2UY09 1125 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 TTC23LQ6PF05 361 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 CYHR1Q6ZMK1 362 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 KDM7AQ6ZMT4 941 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 PIM3Q86V86 326 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-211ENST00000488243 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms