RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 UBALD2Q8IYN6 164 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MYLIPQ8WY64 445 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SCYL1Q96KG9 808 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 BRF2Q9HAW0 419 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DYRK4Q9NR20 520 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PRDM4Q9UKN5 801 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 H0YIV9 168 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 BTN3A1O00481 513 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD28O15084 1053 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPR39O43194 453 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 OTCP00480 354 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NEFHP12036 1026 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TDGF1P13385 188 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CYP2A7P20853 494 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB3P29508 390 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINB1P30740 379 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GCKP35557 465 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 IGFALSP35858 605 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GSTM5P46439 218 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DGKEP52429 567 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CTSCP53634 463 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SDE2Q6IQ49 451 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LCTLQ6UWM7 567 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LAS2Q8IYD9 372 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 EBF4Q9BQW3 602 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 NMUR2Q9GZQ4 415 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TCF7L2Q9NQB0 619 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0U1RQS6 177 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 WDR91A4D1P6 747 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KMOO15229 486 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CAPNS1P04632 268 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGAP8P85298 464 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZP2Q05996 745 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GTF2H2Q13888 395 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LRP8Q14114 963 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 STARD3Q14849 445 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KIAA0040Q15053 153 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ACOX1Q15067 660 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TREML1Q86YW5 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 VRK3Q8IV63 474 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ARHGAP24Q8N264 748 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CADM4Q8NFZ8 388 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SCAMP4Q969E2 229 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 UCK1Q9HA47 277 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PFDN4Q9NQP4 134 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ZIM2Q9NZV7 527 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ITM2BQ9Y287 266 aa6.3□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TBX19O60806 448 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 KATNA1O75449 491 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ANXA5P08758 320 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GABRG2P18507 467 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 CHRM3P20309 590 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPX3P22352 226 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GLRBP48167 497 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 MNAT1P51948 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PON2Q15165 354 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PHKG1Q16816 387 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GRHL2Q6ISB3 625 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 OR4K1Q8NGD4 311 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 FAM3CQ92520 227 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 ERP27Q96DN0 273 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 C19orf60Q96EN9 201 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 PELI2Q9HAT8 420 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 TMED5Q9Y3A6 229 aa6.29□□□□□ -1.4
PRKCI-202ENST00000476635 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.29□□□□□ -1.4
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