RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 TRIM2Q9C040 744 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 POFUT1Q9H488 388 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GAREM1Q9H706 876 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 EFCAB1Q9HAE3 211 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ANKHQ9HCJ1 492 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC6A20Q9NP91 592 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 AMFRQ9UKV5 643 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 PLLPQ9Y342 182 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 NDUFAF1Q9Y375 327 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa5.9□□□□□ -1.46
ECHDC1-215ENST00000475319 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa5.9□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A0B4J269 797 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PPW3 197 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PDZK1P1A8MUH7 402 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 I3L521 148 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC31A2O15432 143 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TXNL1O43396 289 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SGCEO43556 437 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TSPAN3O60637 253 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TMEM127O75204 238 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MBP02144 154 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FCER2P06734 321 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CD63P08962 238 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 GNAO1P09471 354 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ACADMP11310 421 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 IL1R1P14778 569 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CAPN3P20807 821 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CALML3P27482 149 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CD40LGP29965 261 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LIG4P49917 911 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SMCO1Q147U7 214 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 EMC2Q15006 297 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CA9Q16790 459 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF181Q2M3W8 571 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LRRC24Q50LG9 513 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TCEAL6Q6IPX3 200 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RAB12Q6IQ22 244 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 GADL1Q6ZQY3 521 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF765Q7L2R6 523 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RRM2BQ7LG56 351 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NUP54Q7Z3B4 507 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZAR1Q86SH2 424 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LUZP2Q86TE4 346 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 NOXA1Q86UR1 476 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PHC2Q8IXK0 858 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF321PQ8N8H1 164 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 IL17RCQ8NAC3 791 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZBTB44Q8NCP5 570 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 OR6B3Q8NGW1 331 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZFAND1Q8TCF1 268 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ST8SIA4Q92187 359 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF566Q969W8 418 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 VCPIP1Q96JH7 1222 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 FEM1CQ96JP0 617 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CNBD2Q96M20 576 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 GCNAQ96QF7 691 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC25A23Q9BV35 468 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TLR10Q9BXR5 811 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 LDAHQ9H6V9 325 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 CXorf21Q9HAI6 301 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 MLXIPLQ9NP71 852 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 BIN3Q9NQY0 253 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 SAGE1Q9NXZ1 904 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.89□□□□□ -1.47
ECHDC1-215ENST00000475319 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms