RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 ECSITQ9BQ95 431 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 PARVBQ9HBI1 364 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 GIMAP2Q9UG22 337 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM234BA2RU67 622 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 H0Y858 1186 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC28A1O00337 649 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 EEDO75530 441 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 PRNPP04156 253 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 CAPN3P20807 821 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 LTBRP36941 435 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MMP12P39900 470 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF284Q2VY69 593 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 RETREG3Q86VR2 466 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 CATSPER1Q8NEC5 780 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 SPDL1Q96EA4 605 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP10Q9P2G4 905 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP2-202ENST00000435136 C16orf96A6NNT2 1141 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TULP3O75386 442 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 STK16O75716 305 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC22A3O75751 556 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GUCA1CO95843 209 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 EPB42P16452 691 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AKT1P31749 480 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 MAPK9P45984 424 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 AP1S2P56377 157 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GGTA1PQ4G0N0 100 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ASB11Q8WXH4 323 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HLA-CQ95604 372 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ACOX2Q99424 681 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL4Q9C0H6 718 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC32A1Q9H598 525 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPV4Q9HBA0 871 aa18.27■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD17B1P14061 328 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 RPIAP49247 311 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DIO3P55073 304 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM219BQ5XKK7 198 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 IL27RAQ6UWB1 636 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HIPK4Q8NE63 616 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TMIEQ8NEW7 156 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 VN1R2Q8NFZ6 395 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SORCS1Q8WY21 1168 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCD2Q92925 531 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ASB16Q96NS5 453 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 MUC13Q9H3R2 512 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 DZANK1Q9NVP4 752 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CLDND1Q9NY35 253 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ASIC5Q9NY37 505 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SUN2Q9UH99 717 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GFYI3L273 518 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 LSM1O15116 133 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 RGS14O43566 566 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 STAMBPO95630 424 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2A7P20853 494 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP2U1Q7Z449 544 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TRIM46Q7Z4K8 759 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PLCD3Q8N3E9 789 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 SFRP1Q8N474 314 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 FNDC5Q8NAU1 212 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 CDK15Q96Q40 435 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE10AQ9Y233 779 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PRORSD1PA6NEY8 169 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BQ06 376 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HIST1H2ADP20671 130 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 BNIP2Q12982 314 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNC3Q14003 757 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PDGFRLQ15198 375 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS26BQ4G0F5 336 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 Q6ZVL8 140 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 PDSS2Q86YH6 399 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 ZUFSPQ96AP4 578 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 GDE1Q9NZC3 331 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP2-202ENST00000435136 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms