RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 P2RY13Q9BPV8 354 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 SLC12A9Q9BXP2 914 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LMAN2LQ9H0V9 348 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM245Q9H330 911 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PFDN4Q9NQP4 134 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 CDH7Q9ULB5 785 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 COL4A3Q01955 1670 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 EPB42P16452 691 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 ERVK-8P63133 956 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RUNX3Q13761 415 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NR6A1Q15406 480 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 AAGABQ6PD74 315 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 FOXJ1Q92949 421 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 VPS33AQ96AX1 596 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 RAD18Q9NS91 495 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 MSRAQ9UJ68 235 aa22.71■■□□□ 1.23
FAAP20-209ENST00000428120 GCKP35557 465 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PREPP48147 710 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD6Q86V97 674 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 DTD2Q96FN9 168 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SPAG4Q9NPE6 437 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MAP10Q9P2G4 905 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KLQ9UEF7 1012 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ANGPT2O15123 496 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MMP20O60882 483 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MATN4O95460 622 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EPHX1P07099 455 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 C8GP07360 202 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ADRB3P13945 408 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H2ADP20671 130 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 FCHO2Q0JRZ9 810 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HYAL1Q12794 435 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TMIEQ8NEW7 156 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ASZ1Q8WWH4 475 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TIFAQ96CG3 184 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CHFRQ96EP1 664 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 COQ10AQ96MF6 247 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MYADMQ96S97 322 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H2AJQ99878 128 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 H2AFJQ9BTM1 129 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CIDEBQ9UHD4 219 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CROTQ9UKG9 612 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HCN2Q9UL51 889 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC42Q9Y546 428 aa22.7■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 FTH1P02794 183 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 YAF2Q8IY57 180 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CPA6Q8N4T0 437 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC9Q8WXX5 260 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SUSD6Q92537 303 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHAC1Q9H158 963 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 OBP2AQ9NY56 170 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ATG2BQ96BY7 2078 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PRORSD1PA6NEY8 169 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 LSM1O15116 133 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 AP2A2O94973 939 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EPORP19235 508 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ABRQ12979 859 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 VPS35Q96QK1 796 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 CCT7Q99832 543 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.69■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM38O00635 465 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SOD1P00441 154 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 C6P13671 934 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 WASP42768 502 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PSMD8P48556 350 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SLC7A2P52569 658 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 SYTL3Q4VX76 610 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT8Q8WV74 236 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 BRINP2Q9C0B6 783 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 ATG10Q9H0Y0 220 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 H3BNX3 289 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 AREL1O15033 823 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KPNA5O15131 536 aa22.68■■□□□ 1.22
FAAP20-209ENST00000428120 KAT7O95251 611 aa22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms