RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF691Q5VV52 312 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 THAP5Q7Z6K1 395 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM217AQ8IXS0 508 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF170Q96K19 258 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PPM1MQ96MI6 270 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NTMT1Q9BV86 223 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PDHXO00330 501 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA3DO95025 777 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BEX3Q00994 111 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ART3Q13508 389 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SMU1Q2TAY7 513 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MARC1Q5VT66 337 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NIPAL1Q6NVV3 410 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR141Q7Z602 305 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF786Q8N393 782 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2FQ969M7 185 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 COX4I2Q96KJ9 171 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LYSMD1Q96S90 227 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 FUZQ9BT04 418 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UGT2B28Q9BY64 529 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CWH43Q9H720 699 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANAPC2Q9UJX6 822 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVW-1Q9UQF0 538 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf226A1L170 272 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NR5A2O00482 541 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFS2O75306 463 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATF6P18850 670 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SGSHP51688 502 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ARF5P84085 180 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SPANXN4Q5MJ08 99 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKS6Q68DC2 871 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf99Q6UX52 265 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC149Q6ZUS6 474 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DNASE1L2Q92874 299 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TESCQ96BS2 214 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 HBEGFQ99075 208 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH5Q9NX47 278 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAP29Q9UHQ4 241 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 INPP4BO15327 924 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMD3O43242 534 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPA1O75762 1119 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-ND2P03891 347 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 THRBP10828 461 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNQ1P51787 676 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EFNB1P98172 346 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TCTN1Q2MV58 587 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC39A12Q504Y0 691 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ABI1Q8IZP0 508 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 L3MBTL4Q8NA19 623 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQH9 124 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC35F4A4IF30 521 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LDLRP01130 860 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 CAPN1P07384 714 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 UROSP10746 265 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ITGAMP11215 1152 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 LHCGRP22888 699 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 DAPP51397 102 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 NEK5Q6P3R8 708 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC13A3Q8WWT9 602 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 PBXIP1Q96AQ6 731 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 TXNDC15Q96J42 360 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGED4Q96JG8 741 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINB11Q96P15 392 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 EXD2Q9NVH0 621 aa3.55□□□□□ -1.84
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa3.55□□□□□ -1.84
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