RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 PDPRQ8NCN5 879 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM156AQ8NDB6 213 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OR4F6Q8NGB9 312 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ELMO1Q92556 727 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 AP2M1Q96CW1 435 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF382Q96SR6 550 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 C1orf50Q9BV19 199 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 IL1RL2Q9HB29 575 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 MRGBPQ9NV56 204 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 OPTCQ9UBM4 332 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PPM1HQ9ULR3 514 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 COQ6Q9Y2Z9 468 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 UNC80Q8N2C7 3258 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.9□□□□□ -1.78
LRRTM4-201ENST00000409088 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NR5A2O00482 541 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FBP2O00757 339 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 OR7A17O14581 309 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 MRASO14807 208 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FFAR3O14843 346 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GPR42O15529 346 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PRNPP04156 253 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ANXA5P08758 320 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 POU2F2P09086 479 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ANPEPP15144 967 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GPX3P22352 226 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 AOAHP28039 575 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HMOX2P30519 316 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PSME3P61289 254 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 RALGDSQ12967 914 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CEACAM7Q14002 265 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CCNIQ14094 377 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GRM2Q14416 872 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TAF11Q15544 211 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS26BQ4G0F5 336 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 REP15Q6BDI9 236 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FBXL19Q6PCT2 694 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 OR2T11Q8NH01 316 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NRG4Q8WWG1 115 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 RHBDF1Q96CC6 855 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LRIG1Q96JA1 1093 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CD244Q9BZW8 370 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZFP14Q9HCL3 533 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HPS4Q9NQG7 708 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PFDN4Q9NQP4 134 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 NDE1Q9NXR1 346 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ARL15Q9NXU5 204 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 DKK3Q9UBP4 350 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SUN2Q9UH99 717 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HELZP42694 1942 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 TRANK1O15050 2925 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 KRT87PA6NCN2 255 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 E7ENX8 843 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 H3BM21 787 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 K7EPI3 171 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LINC01565O15544 149 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 FKBP6O75344 327 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS4BO75351 444 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 STK16O75716 305 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 OTCP00480 354 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CBSLP0DN79 551 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HIST1H2ADP20671 130 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ME2P23368 584 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 CBSP35520 551 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 MMP12P39900 470 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 VHLP40337 213 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ATP4BP51164 291 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC13P55735 322 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 LRP8Q14114 963 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF234Q14588 700 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 ZNF423Q2M1K9 1284 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 MUM1Q2TAK8 710 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 GAB4Q2WGN9 574 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 SGO1Q5FBB7 561 aa3.9□□□□□ -1.79
LRRTM4-201ENST00000409088 PIGGQ5H8A4 983 aa3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms