RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 PCSK6P29122 969 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 SOX11P35716 441 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 UGT1A3P35503 534 aa22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 PKD2L2Q9NZM6 624 aa22.65■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.64■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 LYSMD1Q96S90 227 aa22.64■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 LRTM1Q9HBL6 345 aa22.64■■□□□ 1.22
RABGGTA-202ENST00000399409 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
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RABGGTA-202ENST00000399409 SCN8AQ9UQD0 1980 aa22.64■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 TMEM169Q96HH4 297 aa22.64■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-202ENST00000399409 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa22.64■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR52E4Q8NGH9 312 aa22.62■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-202ENST00000399409 LOC730098B7Z3J9 87 aa22.61■■□□□ 1.21
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