RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393203.2

PTGFRN-201, Transcript of prostaglandin F2 receptor inhibitor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTGFRN, Length 6,178 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC2A7Q6PXP3 512 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ASB9Q96DX5 294 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GNB5O14775 395 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCCBP05166 539 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ITGB1P05556 798 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MC1RQ01726 317 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PDSS2Q86YH6 399 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ASMTP46597 345 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM74Q96NL1 305 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IRGMA1A4Y4 181 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF432O94892 652 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DAG1Q14118 895 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MED27Q6P2C8 311 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RGL4Q8IZJ4 473 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CLEC4DQ8WXI8 215 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DPF3Q92784 378 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NKD1Q969G9 470 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IL4I1Q96RQ9 567 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CDADC1Q9BWV3 514 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FTHL17Q9BXU8 183 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa15.01□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PRKACGP22612 351 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ALDH3A2P51648 485 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LILRA4P59901 499 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PAQR3Q6TCH7 311 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RTL4Q6ZR62 310 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC22A16Q86VW1 577 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CHST4Q8NCG5 386 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 C1orf109Q9NX04 203 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DPP7Q9UHL4 492 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TMEM59LQ9UK28 342 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 URADA6NGE7 173 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IFNA6P05013 189 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CD247P20963 164 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NT5EP21589 574 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FAUP35544 74 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OGDHQ02218 1023 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NEK7Q8TDX7 302 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MTRRQ9UBK8 725 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 A0A0G2JN53 185 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SEPT4O43236 478 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 NIPSNAP2O75323 286 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PDHA2P29803 388 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 DAOAP59103 153 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PIK3R3Q92569 461 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RNF208Q9H0X6 261 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IGSF9Q9P2J2 1179 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MAZP56270 477 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HERVK_113P63132 956 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SLC30A6Q6NXT4 461 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CYP2U1Q7Z449 544 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR5AK3PQ8NH89 298 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 BAIAP2Q9UQB8 552 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 A8MT66 165 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 AXIN1O15169 862 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 MAP2K5Q13163 448 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 BEND5Q7L4P6 421 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LINGO2Q7L985 606 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ZNF248Q8NDW4 579 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SNX27Q96L92 541 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 TTPALQ9BTX7 342 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 OR1F1O43749 312 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 KRT33AO76009 404 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 IFI44LQ53G44 452 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 STON2Q8WXE9 905 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 LRRC3Q9BY71 257 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 FAM234BA2RU67 622 aa14.99□□□□□ -0.01
PTGFRN-201ENST00000393203 H0YGN5 161 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms