RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR6C74A6NCV1 312 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SMAPO00193 183 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 QSOX1O00391 747 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SNPHO15079 494 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FTH1P02794 183 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GSTM1P09488 218 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ADRA1DP25100 572 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS1P28331 727 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RPL22P35268 128 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 COILP38432 576 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 CD151P48509 253 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ARL4DP49703 201 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4F2P78329 520 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 BASP1P80723 227 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GSTM4Q03013 218 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ACVR1Q04771 509 aa7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 C19orf57Q0VDD7 668 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RPA4Q13156 261 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TUBB3Q13509 450 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ITIH4Q14624 930 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 IL11RAQ14626 422 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SYTL3Q4VX76 610 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TSTD2Q5T7W7 516 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CYB5D1Q6P9G0 228 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RASGRP3Q8IV61 690 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF843Q8N446 348 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PRELID2Q8N945 189 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MNS1Q8NEH6 495 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR4L1Q8NH43 312 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 COG1Q8WTW3 980 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 EXTL1Q92935 676 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 HDAC10Q969S8 669 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RNF31Q96EP0 1072 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ELMO2Q96JJ3 720 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 SLC41A2Q96JW4 573 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF778Q96MU6 729 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KCNK17Q96T54 332 aa7.46□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 RIMKLBQ9ULI2 386 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TCAF1Q9Y4C2 921 aa7.46□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 F8W8V4 182 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MATN2O00339 956 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FANCGO15287 622 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KIAA0754O94854 1291 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 GOT2P00505 430 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 OR56A5P0C7T3 313 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 EBLN1P0CF75 366 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FGF5P12034 268 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF28P17035 718 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 KCNJ1P48048 391 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEP78395 509 aa7.45□□□□□ -1.22
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SGMS1-201ENST00000361543 HSD11B2P80365 405 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD18Q0P651 414 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PRKAA1Q13131 559 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 MAP7Q14244 749 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 KCNAB1Q14722 419 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R7Q15435 360 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TPSAB1Q15661 275 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 TBR1Q16650 682 aa7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
SGMS1-201ENST00000361543 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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