RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 WDSUB1Q8N9V3 476 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HDAC10Q969S8 669 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C19orf12Q9NSK7 152 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HPF1Q9NWY4 346 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TSPAN16Q9UKR8 245 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ATRNO75882 1429 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CYP27B1O15528 508 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ATG12O94817 140 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLITRK5O94991 958 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IFNA17P01571 189 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HLA-DPB1P04440 258 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 PTGIRP43119 386 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX20Q7Z614 316 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA22Q8NHS9 363 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SETD6Q8TBK2 473 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 L7N2F9 121 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CBX4O00257 560 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 POMCP01189 267 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 VAMP2P63027 116 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC26A9Q7LBE3 791 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SNX33Q8WV41 574 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TXN2Q99757 166 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ST14Q9Y5Y6 855 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GVG6 124 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MPSTP25325 297 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFALSP35858 605 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ARF1P84077 181 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 MEDAGQ5VYS4 303 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FN3KQ9H479 309 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FKBP7Q9Y680 259 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TNFRSF11BO00300 401 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPA12AO43301 675 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GADD45AP24522 165 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM169Q96HH4 297 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HYLS1Q96M11 299 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 FEM1AQ9BSK4 669 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 UQCRC1P31930 480 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RELAQ04206 551 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 EFEMP1Q12805 493 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GLYATQ6IB77 296 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf109Q9NX04 203 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CKBP12277 381 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CREB1P16220 341 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NCK1P16333 377 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRIM23P36406 574 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 STT3AP46977 705 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SOX9P48436 509 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CDH15P55291 814 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 KANK2Q63ZY3 851 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB12Q6IQ22 244 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 CUZD1Q86UP6 607 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 SEC14L1Q92503 715 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF696Q9H7X3 374 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TLR6Q9Y2C9 796 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 DISC1C4P0D8 188 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HSBP1L1C9JCN9 74 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF208O43345 1280 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRBC1P01850 177 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 NFE2L1Q14494 772 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 STYK1Q6J9G0 422 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 AP2M1Q96CW1 435 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GNALP38405 381 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RAB5CP51148 216 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 TKTL1P51854 596 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 HMGCS2P54868 508 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 RAPSNQ13702 412 aa10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-201ENST00000356331 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms