RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF470Q6ECI4 717 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MOB2Q70IA6 237 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SYT12Q8IV01 421 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF527Q8NB42 609 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PSD4Q8NDX1 1056 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC38A4Q969I6 547 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KAZALD1Q96I82 304 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NPAS2Q99743 824 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LGR4Q9BXB1 951 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SAGE1Q9NXZ1 904 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 COL20A1Q9P218 1284 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 M0R233 179 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP3O75969 853 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DARSP14868 501 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KLRC2P26717 231 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MTHFRP42898 656 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KLF10Q13118 480 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA5AQ13591 1074 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 DAG1Q14118 895 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CPTPQ5TA50 214 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 LCLAT1Q6UWP7 414 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OTOP1Q7RTM1 612 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SZRD1Q7Z422 152 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TTC7BQ86TV6 843 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HDDC3Q8N4P3 179 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRELID2Q8N945 189 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TERB2Q8NHR7 220 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PIH1D2Q8WWB5 315 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TCEAL3Q969E4 200 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FBXO32Q969P5 355 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ART5Q96L15 291 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC4A9Q96Q91 983 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HINFPQ9BQA5 517 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 POTEKPQ9BYX7 375 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM25EA8MYX2 175 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 WRBO00258 174 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UGDHO60701 494 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RPP40O75818 363 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UBXN7O94888 489 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CLDN9O95484 217 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RHOCP08134 193 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PBX3P40426 434 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACTBP60709 375 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 HERVK_113P63132 956 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACTG1P63261 375 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CCINQ13939 588 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KEAP1Q14145 624 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MIIPQ5JXC2 388 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 COLEC12Q5KU26 742 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 KLHL24Q6TFL4 600 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C6orf89Q6UWU4 347 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SV2AQ7L0J3 742 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 OR51D1Q8NGF3 324 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CDC26Q8NHZ8 85 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf82Q8WW14 230 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ASB15Q8WXK1 588 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM209Q96SK2 561 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ERVK-6Q9BXR3 956 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TLE6Q9H808 572 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 RFXANKO14593 260 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 SEC22BO75396 215 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TPPPO94811 219 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ACPPP15309 386 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TBX4P57082 545 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CYP4F8P98187 520 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 BST1Q10588 318 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ATP6AP1Q15904 470 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 PNCKQ6P2M8 343 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FAM131AQ6UXB0 335 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 VGLL2Q8N8G2 317 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 ING5Q8WYH8 240 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 FIG4Q92562 907 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRD-201ENST00000355233 CBWD1Q9BRT8 395 aa4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms