RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334268.8

TRDN-201, Transcript of triadin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 4,770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-201ENST00000334268 ITGAXP20702 1163 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SDC4P31431 198 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CD79BP40259 229 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ETV3P41162 512 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MAGEA2P43356 314 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PTPN9P43378 593 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RNF4P78317 190 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NME3Q13232 169 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SERINC3Q13530 473 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SCARB2Q14108 478 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CLCA4Q14CN2 919 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C5orf22Q49AR2 442 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FAM219BQ5XKK7 198 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BTBD8Q5XKL5 378 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NUDT13Q86X67 352 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC22A9Q8IVM8 553 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZNF786Q8N393 782 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 COMMD1Q8N668 190 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GANCQ8TET4 914 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IRGQQ8WZA9 623 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LURAP1Q96LR2 239 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MYADMQ96S97 322 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC29A1Q99808 456 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 AIFM2Q9BRQ8 373 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SFXN1Q9H9B4 322 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SYTL2Q9HCH5 934 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ABCC13Q9NSE7 274 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ADGRE2Q9UHX3 823 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC25A13Q9UJS0 675 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRAF6Q9Y4K3 522 aa3.09□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 A0A1W2PQ72 361 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KCNN4O15554 427 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RASAL1O95294 804 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PDGFAP04085 211 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RLN1P04808 185 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GPD1P21695 349 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NOS3P29474 1203 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ECHS1P30084 290 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IFNA8P32881 189 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ADRA1BP35368 520 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLCO1A2P46721 670 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CXCR3P49682 368 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NUMBP49757 651 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SMSP52788 366 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PLTPP55058 493 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 POLE2P56282 527 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ARL4CP56559 192 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CREB5Q02930 508 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TGM3Q08188 693 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MESP2Q0VG99 397 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 RUNX2Q13950 521 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 DGCR6Q14129 220 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LRRC14Q15048 493 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C4orf17Q53FE4 359 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 KLHL22Q53GT1 634 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 IL27RAQ6UWB1 636 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NETO2Q8NC67 525 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FGF14Q92915 247 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HDHD2Q9H0R4 259 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 LINC00597Q9H2U6 94 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SMOC2Q9H3U7 446 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PIDD1Q9HB75 910 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC40A1Q9NP59 571 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 NDFIP2Q9NV92 336 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 FAM53CQ9NYF3 392 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 PDP2Q9P2J9 529 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 POLHQ9Y253 713 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CPQQ9Y646 472 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 SLC12A8A0AV02 714 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 HEATR9A2RTY3 570 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 BTBD17A6NE02 478 aa3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
TRDN-201ENST00000334268 CHUKO15111 745 aa3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms