RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321337.11

SENP3-201, Transcript of SUMO specific peptidase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SENP3, Length 2,611 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3-201ENST00000321337 CCDC115Q96NT0 180 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SCUBE2Q9NQ36 999 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 FKBPLQ9UIM3 349 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 ZBBXA8MT70 800 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 FFAR3O14843 346 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 GPR42O15529 346 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 CHRNA1P02708 482 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SPANXN4Q5MJ08 99 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 DET1Q7L5Y6 550 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 OR8J3Q8NGG0 315 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 CLHC1Q8NHS4 586 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 RDH12Q96NR8 316 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 M0QZQ0 153 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PKMP14618 531 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 MASP1P48740 699 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 GCNT7Q6ZNI0 430 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 NETO1Q8TDF5 533 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 NCLNQ969V3 563 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 VMP1Q96GC9 406 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 MYOCQ99972 504 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 ZFP14Q9HCL3 533 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 GBF1Q92538 1859 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 M0R3G1 203 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PRAMEF11O60813 436 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 NDST3O95803 873 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SERPINF2P08697 491 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 HMGCS1Q01581 520 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 IL1RL1Q01638 556 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PEX13Q92968 403 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.84■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 ELOVL7A1L3X0 281 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 BCKDKO14874 412 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 IL2P60568 153 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 CYP4Z1Q86W10 505 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 OR7D4Q8NG98 312 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PSD2Q9BQI7 771 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 KLHL25Q9H0H3 589 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 VPS26AO75436 327 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 ANGPTL1O95841 491 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 C1QCP02747 245 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 CCL14Q16627 93 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 AFTPHQ6ULP2 937 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SLC10A4Q96EP9 437 aa24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SENP3-201ENST00000321337 B4GALT3O60512 393 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SERPINA1P01009 418 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 VAC14Q08AM6 782 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 NPTX1Q15818 432 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SLC22A16Q86VW1 577 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MON1AQ86VX9 555 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 THEM5Q8N1Q8 247 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SVOPLQ8N434 492 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 CCL27Q9Y4X3 112 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 GRXCR2A6NFK2 248 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ACVR2AP27037 513 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MC4RP32245 332 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 KCNJ8Q15842 424 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SGO1Q5FBB7 561 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ARL10Q8N8L6 244 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 OR5K1Q8NHB7 308 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 RORBQ92753 470 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 YIPF6Q96EC8 236 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PDFQ9HBH1 243 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 C3orf18Q9UK00 162 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 POU2F3Q9UKI9 436 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 GUCA1CO95843 209 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 PRLP01236 227 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 EPOP01588 193 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 RCVRNP35243 200 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 GDF5P43026 501 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 MAPKAPK3Q16644 382 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 NADSYN1Q6IA69 706 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 LGI2Q8N0V4 545 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 EID3Q8N140 333 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 UBE2FQ969M7 185 aa24.82■■□□□ 1.56
SENP3-201ENST00000321337 SLX1AQ9BQ83 275 aa24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms