RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264645.11

CASC3-201, Transcript of CASC3, exon junction complex subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASC3, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC3-201ENST00000264645 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ALPK1Q96QP1 1244 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GRM5P41594 1212 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TSTQ16762 297 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZNF678Q5SXM1 525 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 STK40Q8N2I9 435 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TADA1Q96BN2 335 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BCO2Q9BYV7 579 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CMTM6Q9NX76 183 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LRP6O75581 1613 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PTPRAP18433 802 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TNNI3P19429 210 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LPOP22079 712 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZYG11BQ9C0D3 744 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC25A51Q9H1U9 297 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.85□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RICTORQ6R327 1708 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 A0A1W2PRG6 482 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TMEM221A6NGB7 291 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CRYZL1O95825 349 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TYMPP19971 482 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RORCP51449 518 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CDH18Q13634 790 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BTBD16Q32M84 506 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RNF111Q6ZNA4 994 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ADGRG5Q8IZF4 528 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 IL4I1Q96RQ9 567 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RANBP9Q96S59 729 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MEAF6Q9HAF1 191 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 STYXL1Q9Y6J8 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FPGTO14772 594 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 GUCY1B2O75343 617 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CREG1O75629 220 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CDK14O94921 469 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HSD17B1P14061 328 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 PRKACBP22694 351 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 DNAJB13P59910 316 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FPGSQ05932 587 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 LRP8Q14114 963 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CADM3Q8N126 398 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ARSAP15289 507 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SDC2P34741 201 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 STARD3Q14849 445 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 NHSL2Q5HYW2 709 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 CDC73Q6P1J9 531 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 HFE2Q6ZVN8 426 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 USP30Q70CQ3 517 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC38A4Q969I6 547 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 RDH12Q96NR8 316 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FCRL5Q96RD9 977 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLC39A8Q9C0K1 460 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 VPS4AQ9UN37 437 aa14.84□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ACOT8O14734 319 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 DNAJB5O75953 348 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TMEM199Q8N511 208 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TCF25Q9BQ70 676 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 KIFC1Q9BW19 673 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 MINDY3Q9H8M7 445 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.83□□□□□ -0.03
CASC3-201ENST00000264645 SLIT2O94813 1529 aa14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 PPEF2O14830 753 aa14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 PER2O15055 1255 aa14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 NOVP48745 357 aa14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.83□□□□□ -0.04
CASC3-201ENST00000264645 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms