RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257552.6

MSI1-201, Transcript of musashi RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSI1, Length 2,975 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSI1-201ENST00000257552 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 EID3Q8N140 333 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PJA1Q8NG27 643 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZNF599Q96NL3 588 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RASSF1Q9NS23 344 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TBC1D14Q9P2M4 693 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ORC6Q9Y5N6 252 aa14.52□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NOTOA8MTQ0 251 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 EFCAB9A8MZ26 197 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 IDH3BO43837 385 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ECI2O75521 394 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 OR4F21O95013 312 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PGLSO95336 258 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 KRT8P05787 483 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FDXRP22570 491 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ERVK-8P63133 956 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GATAD2AQ86YP4 633 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TOP6BLQ8N6T0 577 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 UBE2FQ969M7 185 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RDH12Q96NR8 316 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 IKZF5Q9H5V7 419 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ASB1Q9Y576 335 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GJB3O75712 270 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CCDC159P0C7I6 412 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CYBAP13498 195 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PHC1P78364 1004 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CDC20Q12834 499 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 IHHQ14623 411 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ACOX1Q15067 660 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 KDELC1Q6UW63 502 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ADAM2Q99965 735 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DCSTAMPQ9H295 470 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SP140LQ9H930 580 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ARL5AQ9Y689 179 aa14.51□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC7A4O43246 635 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 DNAJB5O75953 348 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CYP11A1P05108 521 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PRR35P0CG20 571 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 WARSP23381 471 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FXNQ16595 210 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SMUG1Q53HV7 270 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 LRRC49Q8IUZ0 686 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SVOPQ8N4V2 548 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PROX1Q92786 737 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PYCR2Q96C36 320 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 BRINP2Q9C0B6 783 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MFSD1Q9H3U5 465 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TTC3P53804 2025 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 ARVCFO00192 962 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TAF4O00268 1085 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PAGE1O75459 146 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RHOBTB1O94844 696 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 NDST3O95803 873 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GLP2RO95838 553 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 OR4Q2P0C623 313 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FMO4P31512 558 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC26A3P40879 764 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 TRAF3Q13114 568 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 OR13C4Q8NGS5 318 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 OPTCQ9UBM4 332 aa14.5□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 J3KR12 359 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GABRDO14764 452 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SSX4O60224 188 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC10A3P09131 477 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GRK3P35626 688 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 GRIK1P39086 918 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 HTR6P50406 440 aa14.49□□□□□ -0.09
MSI1-201ENST00000257552 SLC10A7Q0GE19 358 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms