RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 RNF11Q9Y3C5 154 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 OR2AG2A6NM03 316 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 LOC730098B7Z3J9 87 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 FXYD1O00168 92 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 KPNA5O15131 536 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 EBLN1P0CF75 366 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 EPORP19235 508 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 IL12AP29459 219 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SLC7A2P52569 658 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 EMX2Q04743 252 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ACOX1Q15067 660 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TMIEQ8NEW7 156 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ELMO1Q92556 727 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ARRDC3Q96B67 414 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 PCDHAC1Q9H158 963 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SLC32A1Q9H598 525 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 OBP2AQ9NY56 170 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 GDE1Q9NZC3 331 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ZIM2Q9NZV7 527 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TRPS1Q9UHF7 1281 aa18.1■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 A0A1W2PP18 115 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ASPDHA6ND91 283 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 PIK3CGP48736 1102 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 LDLRAP1Q5SW96 308 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TANGO2Q6ICL3 276 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TTC23LQ6PF05 361 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 RASGRP3Q8IV61 690 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 NRSN1Q8IZ57 195 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 MINDY1Q8N5J2 469 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 PROKR1Q8TCW9 393 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 GLYATL1Q969I3 302 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 AP2M1Q96CW1 435 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 COQ10AQ96MF6 247 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TRIM54Q9BYV2 358 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 IL1RL2Q9HB29 575 aa18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM202A6NGA9 273 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 PSMD11O00231 422 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 FFAR3O14843 346 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 WNT9AO14904 365 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SLC16A5O15375 505 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 GPR42O15529 346 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SLCO2B1O94956 709 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 FTH1P02794 183 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ITGB7P26010 798 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 CTSCP53634 463 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 KCNK10P57789 538 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 SP140Q13342 867 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF234Q14588 700 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 NR6A1Q15406 480 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 AP5B1Q2VPB7 878 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 LPCAT4Q643R3 524 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ZFP1Q6P2D0 407 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 OR8D1Q8WZ84 308 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 VPS33AQ96AX1 596 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 FAM129BQ96TA1 746 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM245Q9H330 911 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 ABCD2Q9UBJ2 740 aa18.08■□□□□ 0.49
HOXC11-201ENST00000243082 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 EPOPA6NHQ4 379 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 H0Y858 1186 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2ADP20671 130 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 SLC6A12P48065 614 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 YBX1P67809 324 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 PDGFRLQ15198 375 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 C6orf10Q5SRN2 563 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 GPR149Q86SP6 731 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 ASZ1Q8WWH4 475 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 LRRC58Q96CX6 371 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 DTD2Q96FN9 168 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 HIST1H2AJQ99878 128 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 ECSITQ9BQ95 431 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 H2AFJQ9BTM1 129 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 LMAN2LQ9H0V9 348 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 IGFLR1Q9H665 355 aa18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
HOXC11-201ENST00000243082 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.4 ms