RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223129.8

RPA3-201, Transcript of replication protein A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPA3, Length 2,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3-201ENST00000223129 POU4F1Q01851 419 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 HHEXQ03014 270 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 BIRC2Q13490 618 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC9B2Q86UD5 537 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 FERD3LQ96RJ6 166 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 CDC6Q99741 560 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 DHRS4Q9BTZ2 278 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 SLC32A1Q9H598 525 aa14.65□□□□□ -0.06
RPA3-201ENST00000223129 GIPC1O14908 333 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 GLB1P16278 677 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 GMPRP36959 345 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SLC12A2P55011 1212 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 PERM1Q5SV97 790 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 MREGQ8N565 214 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CCDC77Q9BR77 488 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 KLHL42Q9P2K6 505 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ASF1AQ9Y294 204 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ASXL3Q9C0F0 2248 aa14.64□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CCDC151A5D8V7 595 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SMIM23A6NLE4 172 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TNFSF14O43557 240 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SLCO1A2P46721 670 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 FASLGP48023 281 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 PRKG2Q13237 762 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 KRT33BQ14525 404 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CCDC157Q569K6 752 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ADGRD1Q6QNK2 874 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CYHR1Q6ZMK1 362 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 OR5AR1Q8NGP9 310 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 IFI44Q8TCB0 444 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CCDC74AQ96AQ1 378 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 NRTNQ99748 197 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 GPAMQ9HCL2 828 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SLC40A1Q9NP59 571 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 OGFRQ9NZT2 677 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TBK1Q9UHD2 729 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ZNF180Q9UJW8 692 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 PIEZO1Q92508 2521 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 RP1P56715 2156 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 RHPN2P1A8MT19 583 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ERLIN1O75477 346 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 STMN1P16949 149 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ZBTB9Q96C00 473 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 LINGO1Q96FE5 620 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 POT1Q9NUX5 634 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CIDEBQ9UHD4 219 aa14.63□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TSPAN12O95859 305 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CBSLP0DN79 551 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ACP1P24666 158 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ALDH4A1P30038 563 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 CBSP35520 551 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ACADVLP49748 655 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SERPINB9P50453 376 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 IL2P60568 153 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 RAB10P61026 200 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 GPR18Q14330 331 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 RAPH1Q70E73 1250 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SPATA6LQ8N4H0 392 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TSPAN17Q96FV3 270 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SLC38A3Q99624 504 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 FETUBQ9UGM5 382 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 SLC24A2Q9UI40 661 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa14.62□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 KRT87PA6NCN2 255 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 TRIM49D1C9J1S8 452 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 KRT38O76015 456 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 MATN4O95460 622 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 NUDT17P0C025 328 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 ATP5DP30049 168 aa14.61□□□□□ -0.07
RPA3-201ENST00000223129 OR1D5P58170 312 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms